肉雞腹脂率雙向選擇系群體表型數(shù)據(jù)庫設計及其功能實現(xiàn).pdf

1、表型性狀的準確記錄及其有效管理和分析是選育優(yōu)良畜禽品種（系）工作的一項重要內(nèi)容。東北農(nóng)業(yè)大學肉雞腹脂率雙向選擇系(Northeast Agricultural University High and Low Fa，NEAUHLF)進行了20多年的選育工作，并積累了大量同肉雞脂肪沉積的分子遺傳基礎研究相關的表型性狀記錄。為了有效和系統(tǒng)地存儲、管理、分析和利用這些表型數(shù)據(jù)，本研究設計并構(gòu)建了東北農(nóng)業(yè)大學肉雞腹脂率雙向選擇系群體表型數(shù)據(jù)庫管理

2、系統(tǒng)(NEAUHLFPhenome Database，NEAUHLFPD)。該數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)存儲記錄了多項表型性狀記錄信息和數(shù)據(jù)，還可伺時滿足篩選、檢索和計算等功能。數(shù)據(jù)庫的具體內(nèi)容、設置以及功能相關信息如下:
　　一、NEAUHLFPD表型數(shù)據(jù)庫涵蓋的主要表型記錄和信息
　　(1)1-17世代系譜記錄:具體涉及家系編號、個體序號、個體編號、父母代編號、全同胞家系編號、半同胞家系編號等;
　　(2)29項表型數(shù)據(jù):分別

3、為雞體尺性狀、不同周齡體重性狀、屠體性狀以及腹脂率、肝脂率、內(nèi)臟比率等性狀信息。
　　二、NEAUHLFPD表型數(shù)據(jù)庫的架構(gòu)和設計過程
　　(1)架構(gòu)信息:選擇Apache環(huán)境作為NEAUHLFPD表型數(shù)據(jù)庫搭建的WEB服務器;選擇MySQL數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)軟件作為數(shù)據(jù)庫搭建工具;選擇Navicat作為數(shù)據(jù)庫管理工具;選擇PHP作為動態(tài)交互性站點創(chuàng)建的服務器端腳本語言;選擇HTML作為超文本標記語言。
　　(2)結(jié)構(gòu)信息:主

4、界面上有數(shù)據(jù)庫整體組成及功能詳細介紹，以及數(shù)據(jù)庫各部分基本結(jié)構(gòu)的索引按鈕。數(shù)據(jù)庫功能模塊主要包含兩方面內(nèi)容。第一模塊，為表型（phenotype）數(shù)據(jù)的物理存儲空間，主要用于實現(xiàn)數(shù)據(jù)指標的選定、范圍設定、篩選、和查找等功能;第二模塊，為表型數(shù)據(jù)的基本描述性統(tǒng)計計算(descriptive statistics)，主要用于實現(xiàn)對條件篩選后的數(shù)據(jù)進行基本統(tǒng)計量（平均數(shù)、標準差、方差、眾數(shù)以及中位數(shù)等）的計算，同時還可實現(xiàn)對篩選數(shù)據(jù)的按條件排