水分脅迫誘導(dǎo)表達(dá)基因在水、旱稻幼苗中的表達(dá)分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、水分脅迫是嚴(yán)重影響作物生產(chǎn)的環(huán)境脅迫之一。根據(jù)水分供應(yīng)情況,稻類作物經(jīng)過長期的人工選擇和自然選擇分化為水稻和旱稻,水稻是天然“敏旱類型”,旱稻則是“抗旱類型”,為了初步闡明水、早稻水分脅迫分子反應(yīng)機(jī)制的差別,并據(jù)此發(fā)掘抗旱候選相關(guān)基因,我們進(jìn)行了以下研究。 首先,為了獲得早稻IRAT109的水分脅迫誘導(dǎo)表達(dá)基因,通過抑制性差減雜交(SSH)的方法,以15%PEG(6000)處理的早稻IRAT109幼苗為tester,未處理的對照

2、材料為driver,構(gòu)建了含有2112個克隆的差減cDNA文庫。 為了分析水稻和早稻的水分脅迫分子應(yīng)答機(jī)制的差異,將文庫中所有克隆擴(kuò)增、純化后制作cDNA miroarray,每個克隆重復(fù)3次。以15%PEG(6000)處理的兩個水稻品種(越富、日本晴)和兩個旱稻品種(IRAT109、毫格勞)的根和葉片的RNA為檢測樣品與cDNA芯片雜交。結(jié)果顯示芯片上絕大部分基因在水稻和早稻中的表達(dá)沒有顯著差別,通過T檢驗(yàn)(p=0.05)鑒定

3、了水、早稻差異表達(dá)EST 152個,其中早稻表達(dá)量大于水稻的EST 68個(葉片42個,根32個,6個重疊),水稻表達(dá)量大于早稻的EST 84個(葉片67個,根24個,7個重疊)。 對所有水、早稻差異表達(dá)EST進(jìn)行測序,BLAST分析表明,大部分在旱稻中高表達(dá)的基因代表了與脅迫應(yīng)答相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子(NAC蛋白、乙烯響應(yīng)元件結(jié)合蛋白、包含AP2結(jié)構(gòu)域蛋白)、以及與抵御活性氧傷害和維持細(xì)胞膨壓有關(guān)的基因。而在水稻中高表達(dá)的基因則大多與

4、抗旱無關(guān)甚至與脅迫造成的傷害反應(yīng)有關(guān),如與降解細(xì)胞組分有關(guān)的多聚半乳糖醛酸酶和α-半乳糖苷酶等。 通過芯片篩選發(fā)現(xiàn)一個在根和葉中都表現(xiàn)為旱稻表達(dá)量顯著高于水稻的EST,經(jīng)BLAST分析推測其代表的基因編碼myo-肌醇加氧酶,為了進(jìn)一步研究它的功能,我們克隆了該基因的全長cDNA。此外,我們還克隆了一個編碼產(chǎn)物未知的旱稻高表達(dá)基因,這兩個基因分別命名為OsMIOX和OsUNK1,并對這兩個基因構(gòu)建了植物超表達(dá)載體,為功能研究奠定基

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