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文檔簡介
1、運用線粒體DNA COI和Cytb、ITS-1序列片段、ISSR,分別對我國五大淡水湖:洞庭湖(DT)、太湖(TH)、巢湖(CH)、洪澤湖(HZ),及鄱陽湖內(nèi)進賢(PJ)、余干(PY)、珠湖(PZ)、都昌(PD)、湖口(PH)、永修(YX)合計10個群體三角帆蚌的遺傳多樣性和親緣關(guān)系進行了研究。 對10個群體三角帆蚌69個個體線粒體DNA COI和Cytb進行PCR擴增、序列測定,獲得同源基因序列。同源基因序列分析顯示,mtDN
2、A COI Cytb基因片段中,A+T含量都明顯大于G+C含量。mtDNA COI和Cytb中分別檢測到42個和40個單倍型,332個和329個核苷酸多態(tài)位點。mtDNA COI和Cytb基因序列的遺傳距離表明,五大湖群體間遺傳距離較遠,群體之間的遺傳距離分別為0.0111到0.0422之間和0.O101到0.0412之間,各為獨立的種群;鄱陽湖六個點群體間遺傳距離很近,分別僅為0.0021到0.0073之間和0.0012到0.0051
3、之間,為一個種群。mtDNA COI和Cytb分子系統(tǒng)樹都顯示,鄱陽湖6個群體聚在一起,并與巢湖群體親緣關(guān)系相近,然后鄱陽湖、巢湖這二個群體再和太湖群體聚在一起。洞庭湖群體和洪澤湖群體親緣關(guān)系相近,單獨為一支。 對10個群體三角帆蚌78個個體核糖體DNA基因轉(zhuǎn)錄間隔子ITS-1進行PCR擴增、序列測定,獲得78條長度為430bp的同源序列。同源基因序列分析顯示,五大淡水湖10個群體三角帆蚌78條ITS-1序列片段,G+C的含量都
4、明顯高于A+T的含量。鄱陽湖三角帆蚌的核苷酸多態(tài)性指數(shù)最高,而巢湖的核苷酸多樣性指數(shù)最低?;贗TS-1序列片段的遺傳距離表明,鄱陽湖內(nèi)六個點群體間遺傳距離很小,在0.0071到0.0092之間。五大湖間三角帆蚌群體遺傳距離較遠,在0.0752到0.1381之間。ITS-1序列片段構(gòu)建系統(tǒng)樹顯示,鄱陽湖6個群體聚在了一起為單獨一支,并與巢湖群體親緣關(guān)系相近。洞庭湖群體和洪澤湖群體親緣關(guān)系相近,單獨為一支。太湖群體從鄱陽湖、巢湖群體分離開
5、來,單獨為一支。 運用ISSR對10個群體三角帆蚌進行研究。利用篩選獲得的5條ISSR引物進行PCR擴增,POPGENE結(jié)果分析。計算Na、Ne、H和I各項數(shù)值,發(fā)現(xiàn)鄱陽湖的遺傳多樣性最高,洪澤湖群體最低。遺傳距離計算表明,鄱陽湖內(nèi)六個點群體間遺傳距離相對較近,遺傳距離在0.0143到0.0561之間,五大湖間群體遺傳距離相對較遠,遺傳距離在0.1637到0.3341之間。系統(tǒng)樹構(gòu)建顯示,鄱陽湖6個群體聚在一起,并與巢湖群體親緣
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