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文檔簡介
1、目的: CC亞家族趨化因子巨噬細(xì)胞炎性蛋白-1α(macrophage inflammatory protein1-α, MIP-1α,CCL-3)在臨床水平與疾病關(guān)聯(lián)的研究也越來越受重視,在基因水平研究MIP-1α與疾病的預(yù)防、發(fā)生、發(fā)展和預(yù)后的判斷也是越來越受到眾多醫(yī)學(xué)科學(xué)工作者的關(guān)注。MIP-1α對巨噬細(xì)胞、單核細(xì)胞均有趨化活性,并且能誘導(dǎo)產(chǎn)生炎癥細(xì)胞因子,從而可以影響肉芽腫的發(fā)生和發(fā)展。MIP-1α基因的單核苷酸多態(tài)性(SNP)
2、與疾病的相關(guān)性也逐步被人們所認(rèn)識。本課題通過對MIP-1α基因rs1130371(C/T)、rs1719134(A/G)兩個多態(tài)性位點(diǎn)與結(jié)核病的關(guān)聯(lián)性研究來探討其與寧夏海原地區(qū)結(jié)核病遺傳易感性的關(guān)聯(lián)。
方法:本研究采用以醫(yī)院為基礎(chǔ)的病例-對照研究設(shè)計,選擇寧夏海原地區(qū)154例臨床確診為結(jié)核病的病例組,平均年齡(43.41±19.65),男女比例為79:75,選取與其性別年齡相匹配的寧夏海原地區(qū)的190例健康人群作為對照組,平均
3、年齡在(43.11±15.90),男女比例為91:99。用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性分析(PCR-RFLP)對rs1719134(A/G)位點(diǎn)進(jìn)行基因分型;隨機(jī)選取各100例病例和對照樣本,平均年齡分別為43.36±22.36(病例組)和42.35±21.97(對照組),男女比例分別為57:43和59:41,用測序的方法對rs1130371(C/T)進(jìn)行基因分型。用SPSS11.5統(tǒng)計學(xué)軟件分別計算其基因型、等位基因頻率,并進(jìn)行
4、卡方檢驗;同時用SHE sis軟件對2個SNP位點(diǎn)進(jìn)行連鎖不平衡分析。對MIP-1α基因rs1719134和RANTES IN1.1位點(diǎn)、403位點(diǎn)、28位點(diǎn)用SHE sis軟件進(jìn)行連鎖不平衡分析。
結(jié)果:1 MIP-1α基因rs1719134位點(diǎn)與結(jié)核病的遺傳易感性的相關(guān)性分析結(jié)果:
1.1寧夏海原地區(qū)樣本rs1719134位點(diǎn)基因型和等位基因分布:病例組AA基因型為27.9%,AG基因型為63.0%,GG基因型為
5、9.1%,對照組中AA基因型為17.9%,AG基因型為71.1%,GG基因型為11.1%。用SPSS軟件進(jìn)行卡方檢驗,結(jié)果顯示其分布在病例組和對照組中有統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.027,OR=1.777(1.066-2.964));病例組中A等位基因為59.4%,G等位基因為40.6%,對照組中A等位基因為40.6%,G等位基因為59.4%。用SPSS軟件進(jìn)行卡方檢驗,結(jié)果顯示其分布在病例組和對照組中無統(tǒng)計學(xué)差異(P>0.05)。
6、2 MIP-1α基因rs1130371位點(diǎn)與結(jié)核病的遺傳易感性的相關(guān)性分析結(jié)果:隨機(jī)選擇病例組和對照組各100例進(jìn)行測序分析,結(jié)果顯示CC,CT基因型和等位基因C,T在病例對照樣本中分布無顯著性差異(P>0.05),本實驗發(fā)現(xiàn)總樣本200例均無TT基因型。
3 用SHE sis軟件對MIP-1α基因rs1130371和rs1719134進(jìn)行連鎖不平衡分析,D’值為0.209,r2值為0.003,說明這兩個SNP位點(diǎn)連鎖不平衡關(guān)
7、系不緊密。
4 對MIP-1α基因rs1130371,rs1719134和RANTES IN1.1位點(diǎn),403位點(diǎn),28位點(diǎn)各基因型用SHE sis軟件進(jìn)行連鎖不平衡分析,D’值均<0.8,表明MIP-1α基因和RANTES基因SNP位點(diǎn)連鎖不平衡關(guān)系不緊密。
結(jié)論:1 MIP-1α基因rs1719134(A/G)與寧夏海原地區(qū)樣本中結(jié)核病的發(fā)病有一定的關(guān)聯(lián)性,其野生型AA基因型可能和寧夏海原地區(qū)結(jié)核病發(fā)病有關(guān)聯(lián)。<
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