家兔POMC和UCP2基因?qū)ιL(zhǎng)性狀、屠體性狀和部分肉質(zhì)性狀的遺傳效應(yīng)研究.pdf

1、家兔的體重和生長(zhǎng)速度取決于采食和能量消耗之間的平衡，同時(shí)，出欄體重與生長(zhǎng)速度對(duì)胴體質(zhì)量和兔肉品質(zhì)具有顯著影響，因此，涉及采食和能量消耗兩大生理生化過(guò)程的基因有可能與家兔生長(zhǎng)性狀、屠體性狀和肉質(zhì)性狀相關(guān)聯(lián)。減食欲神經(jīng)肽阿黑皮素原基因(Pro-opiomelanocortin，POMC)和解偶聯(lián)蛋白2基因（uncoupling protein2，UCP2）分別涉及采食和能量消耗兩大過(guò)程。本試驗(yàn)以伊拉兔、香檳兔、天府黑兔、新西蘭兔和歐洲大白兔

2、共計(jì)797個(gè)樣本為材料（其中，伊拉兔、香檳兔和天府黑兔測(cè)定生長(zhǎng)性狀、屠體性狀和肉質(zhì)性狀，新西蘭兔和歐洲大白兔只測(cè)定生長(zhǎng)性狀），以POMC和UCP2為候選基因，采用直接測(cè)序法尋找兩個(gè)基因編碼區(qū)的遺傳變異，研究候選SNPs與家兔部分生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)性，并對(duì)UCP2基因mRNA相對(duì)表達(dá)量進(jìn)行了分析，研究結(jié)果如下:
　　1.在POMC基因外顯子2上檢測(cè)到一個(gè)同義突變c.498 T＞G，在內(nèi)含子1上檢測(cè)到一個(gè)突變位點(diǎn)c.112-12 G＞T。

3、多態(tài)性分析表明，c.498 T＞G在伊拉兔、香檳兔和天府黑兔三個(gè)品種中均只檢測(cè)到GT和GG兩種基因型，且表現(xiàn)為低度多態(tài)(PIC＜0.25); c.112-12 G＞T在伊拉兔、香檳兔和天府黑兔三個(gè)品種中檢測(cè)到GG、GT和TT三種基因型，且均表現(xiàn)為中度多態(tài)(0.25＜PIC＜0.50)。x2檢驗(yàn)表明，兩個(gè)位點(diǎn)均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P＞0.05)。
　　2.POMC基因c.112-12 G＞T位點(diǎn)對(duì)伊拉兔、香檳兔

4、和天府黑兔的84日齡體重、全凈膛重和半凈膛重的遺傳效應(yīng)達(dá)到顯著水平(P＜0.05)，其中，TT基因型的84日齡體重、全凈膛重和半凈膛重均顯著高于GT基因型（P＜0.05）;雖然該位點(diǎn)對(duì)熟肉率的遺傳效應(yīng)沒(méi)有達(dá)到顯著水平，但多重比較的結(jié)果表明，TT基因型的熟肉率顯著高于GG基因型(P＜0.05); c.498 T＞G位點(diǎn)對(duì)家兔生產(chǎn)性狀的遺傳效應(yīng)均沒(méi)有達(dá)到顯著水平(P＞0.05)。
　　3.在UCP2基因中一共檢測(cè)到14個(gè)變異位點(diǎn)，其中

5、6個(gè)為位于編碼區(qū)的同義突變:c.72 G＞A（外顯子1，Ala，GCG＞GCA）;c.129 T＞C(外顯子2，Ile，ATT＞ATC); c.249 A＞G(外顯子2，Val，GTA＞GTG); c.252 T＞C(外顯子2，Ala，GCT＞GCC); c.300 T＞C（外顯子2，Tyr，TAT＞TAC）;c.546 C＞A(外顯子4，Pro，CCC＞CCA)。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)，6個(gè)SNPs均位于Solcar結(jié)構(gòu)域，其中，c.7

6、2 G＞A與c.129 T＞C位于第一個(gè)跨膜螺旋結(jié)構(gòu)域，c.249 A＞G; c.252 T＞C和c.300 T＞C位于第二個(gè)跨膜螺旋結(jié)構(gòu)域中，c.546 C＞A位于第四個(gè)跨膜螺旋結(jié)構(gòu)域。連鎖不平衡分析顯示，c.72 G＞A與其余5個(gè)SNPs位點(diǎn)連鎖程度非常強(qiáng)(r2≥0.55)，說(shuō)明該位點(diǎn)與其余5個(gè)位點(diǎn)具有相近的遺傳效應(yīng)，最終選擇c.72 G＞A位點(diǎn)進(jìn)行后續(xù)研究。
　　4.UCP2基因c.72 G＞A位點(diǎn)在5個(gè)家兔品種中均表現(xiàn)為中

7、度多態(tài)(0.25＜PIC＜0.50);x2檢驗(yàn)表明，c.72 G＞A位點(diǎn)在伊拉兔、香檳兔和天府黑兔中處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P＞0.05)，而在新西蘭兔和歐洲大白兔兩個(gè)品種中嚴(yán)重偏離Hardy-Weinberg平衡（P＜0.01）。
　　5.關(guān)聯(lián)分析表明，UCP2基因c.72 G＞A位點(diǎn)在伊拉兔、香檳兔和天府黑兔三個(gè)品種中對(duì)70日齡體重、84日齡體重、全凈膛重、半凈膛重和肌肉24小時(shí)pH的遺傳效應(yīng)達(dá)到極顯著水平(

8、P＜0.01)，對(duì)平均日增重、半凈膛屠宰率的遺傳效應(yīng)達(dá)到顯著水平(P＜0.05)。其中，AA和AG基因型的70日齡體重、84日齡體重、全凈膛重和半凈膛重極顯著高于GG基因型(P＜0.01)，AA和AG基因型的平均日增重和半凈膛屠宰率顯著高于GG基因型(P＜0.05)，GG基因型個(gè)體的背最長(zhǎng)肌肌肉24小時(shí)pH極顯著高于AA和AG基因型(P＜0.01)，GG基因型個(gè)體的后腿肌肌肉24小時(shí)pH顯著高于AA和AG基因型(P＜0.05)。同時(shí)，c

9、.72 G＞A位點(diǎn)與新西蘭兔和歐洲大白兔的56日齡體重、70日齡體重以及35-70日齡的平均日增重顯著相關(guān)。其中，在新西蘭兔群體中，AA基因型的56日齡體重、70日齡體重和35-70日齡的平均日增重極顯著高于AG和GG基因型(P＜0.01);在歐洲大白兔中，AA基因型個(gè)體的56日齡體重顯著高于AG基因型(P＜0.05)，極顯著高于GG基因型(P＜0.01)，AA基因型個(gè)體的70日齡體重極顯著高于AG和GG基因型（P＜0.01），35-7

10、0日齡平均日增重AA基因型顯著高于GG基因型(P＜0.05)。
　　6.mRNA相對(duì)表達(dá)量分析表明，新西蘭兔UCP2基因在肝臟組織中的mRNA表達(dá)量隨著日齡的增加呈現(xiàn)逐漸下降的趨勢(shì)，其中，35日齡的表達(dá)量（2.2750±0.251）極顯著高于56日齡（1.3702±0.272，P=0.01）和70日齡的表達(dá)量（0.8109±0.266，P=0.001）;而56日齡的mRNA表達(dá)量顯著高于70日齡(P=0.029)。c.72 G＞A