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1、Y770313後旦大擎碩士學(xué)位論文學(xué)校代碼:10246學(xué)弓:022023038DNA芯片動(dòng)力學(xué)初探及應(yīng)用eDNA芯片研究前列腺癌表達(dá)譜院系:專業(yè):姓名:指導(dǎo)教師:完成日期:遺傳所遺傳學(xué)王玉李瑤教授2005年5月6日復(fù)旦大學(xué)碩士學(xué)位論文AbstractDNAmicroarraycanbeusedtomeasureDNAandRNAvariationinapplicationsincludinggeneexpressionprofiling
2、,comparativegenomiCS,andgenotypingTheanalysiSofgeneexpressionprofileiSodeofthemostcommonapplicationsofDNAmicroarrays。Expressi011microarraysareoftenconstructedbyimmobilizingprobesofeDNAandoligonucleotideontwo—dimensionalm
3、odifiedglassSlidesIntheutilityofcurrentmicroarrayformats,thehybridizationefficiencyresultsfromthecombinationofmanyfactorsThedynamicbehavioriSakeyaspectinhybridizationefficiencyandmakesanimportantcontributiontothefinalSig
4、nalintensityofDNAmicroarrayAtheoreticaldynamickineticmodelwasderived,andaseriesofexperimentscarriedoutUSinglOW—densitymicroarraysinvariousconcentrationsofspottingprobe([P])andlabellagtarget([T])Ithasbeenshownthattargetan
5、dprobedeterminedthesignalintensitytogetherAtacertainrangeofDNAconcentrationthesignalintensitywasinproportionofspotting[P]AtthehigherDNAconcentrationtherewasadecreasetendencyinhybridizationsignalintensity,especiallyincDNh
6、microarraySinceDNAmicroarraywasconstructedonthesolidsurface,sterichindrancethatinducedbythesolidsurfaceandthehigh[P]decreasedtheprobeimmobilizationefficiency,leadingtothedecreaseoftheinwnobilizedprobedensityThedecreasedh
7、ybridizationefficiencycausedthecompressioninsignalintensitywhenthetargetincreasedaswel1Nevertheless,theintensityratiovalueofCy5toCy3wasnotcompressedwithinamicroarrayinthetwo—colorsystemTheratioofCyS/Cy3isonlydeterminedby
8、theratiooftwotargetsandindependentofthedensityandthetypesofprobeIntheapplicationresearchofDNAmicroarray,weusedeDNAmicroarraystoprofilechangesingeneexpressionofprostatecanceronagenomicscaleGeneexpressionprofilesof7androge
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