MicroRNAs在雞感染腸炎沙門氏菌中的表達調控.pdf

1、MicroRNAs（miRNAs）大小為20~25個核苷酸，存在于真核生物體內，是一類內源性的具有調控功能的非編碼RNA。miRNAs通過堿基互補配對的方式識別靶mRNA，并根據(jù)互補程度的不同指導沉默復合體降解靶mRNA或者阻遏靶mRNA的翻譯。相關的研究顯示，gga-mir-1662、gga-mir-215和gga-mir-1416與雞腸炎沙門氏菌的感染相關，且gga-mir-1662與TLR1LA、gga-mir-1416與BCL1

2、0可能存在靶向關系。
　　SNP（single nucleotide polymorphism）是基因組DNA堿基的變異，在基因組中的發(fā)生頻率較高，有意義的變異會影響到基因組DNA組成元件的功能、轉錄產生的mRNA水平、蛋白的表達，進而影響基因的功能，導致生物性狀改變甚至致病。因此 SNP被廣泛用于群體遺傳學研究（如生物的起源、進化及遷移等方面），和疾病相關基因的研究，在藥物基因組學、診斷學和生物醫(yī)學研究中起重要作用。
　　

3、本研究從 miRNA與靶基因的表達以及 miRNA的變異兩個方面研究其在雞腸炎沙門氏菌感染中的作用機制。用腸炎沙門氏菌感染2日齡濟寧百日雞，在感染后的第1天、第3天、第7天、第14天、第21天、第28天和第35天采集空腸組織樣品，實驗組和對照組各4只，提取組織總RNA后檢測相關microRNA和靶基因的表達量；感染后第7天取200只濟寧百日雞的盲腸內容物和血液，分別用來檢測腸炎沙門氏菌的含量和提取基因組 DNA，設計相應引物，擴增 mi

4、RNA的目的片段，進行測序、分型，對 SNP位點與腸道內容物腸炎沙門氏菌含量進行關聯(lián)分析。研究結果顯示：
　　1）不同的 microRNA對照組和實驗組差異表達的時間點不同，gga-mir-1662和gga-mir-215在感染后的第7天達到差異表達的高峰，試驗組的表達量分別是對照組的1.6倍和1.66倍。gga-mir-1416則在21日齡表現(xiàn)出明顯的上調表達，實驗組是對照組的1.5倍。
　　2）microRNA及其潛在靶

5、基因不是在每個時間點能表現(xiàn)出明顯的靶向關系，可能與機體的復雜調控有關系。感染后的第7天，gga-mir-1662明顯上調，TLR1LA明顯下調，靶向關系明顯；gga-mir-1416與BCL10在感染后的第21天和第28天差異顯著，但不能表現(xiàn)出明顯的靶向關系。
　　3）不同的 microRNA在體內的變化趨勢不同，對照組和實驗組表現(xiàn)出相近的表達趨勢。相對于各個不同時間點的表達，總體而言，感染后的第1天、第3天、第7天、第14天屬于

6、高表達時間點，而第21天、第28天、第35天屬于低表達時間點。
　　4）對個體分型之后與腸炎沙門氏菌含量相關聯(lián)，發(fā)現(xiàn)了4個與腸炎沙門氏菌感染相關的SNP位點突變，分別為rs18823870、rs312707374、rs316396584、rs314185118。rs18823870位于 gga-mir-215上游， rs312707374、rs316396584、rs314185118位于gga-mir-1416上游，進一步說明