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文檔簡介
1、目的:應(yīng)用生物信息學(xué)方法和分子生物學(xué)技術(shù),在宮頸癌Hela細(xì)胞中預(yù)測(cè)并驗(yàn)證miR-21的相關(guān)靶基因,探討miR-21與靶基因的相互作用及其與宮頸癌發(fā)病的關(guān)系,為進(jìn)一步研究宮頸癌發(fā)生的分子機(jī)制和宮頸癌基因治療方法提供新的思路和實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
方法:⑴應(yīng)用生物信息學(xué)方法分析miR-21的染色體定位、保守性分析等,利用網(wǎng)絡(luò)共享軟件MicroCosm Targets、TargetScan和PicTar,分析其可能作用的靶基因。⑵用脂質(zhì)
2、體轉(zhuǎn)染的方法,將美國Ambion公司合成的pre-miR-21、pre-miRnegative control和anti-miR-21、anti-miR negative control瞬時(shí)轉(zhuǎn)染入Hela細(xì)胞中,實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)方法檢測(cè)miR-21相對(duì)表達(dá)量。⑶蛋白免疫印跡方法(Western-blot):提取細(xì)胞總蛋白,經(jīng)電泳、轉(zhuǎn)膜、PDCD4抗體孵育,曝片顯影,利用軟件對(duì)PDCD4蛋白的相對(duì)含量進(jìn)行分析。⑷熒光素
3、酶報(bào)告實(shí)驗(yàn):將PDCD4分子的3'UTR序列中miR-21結(jié)合位點(diǎn)上下游的部分片段導(dǎo)入pMIR-REPORT-luciferace熒光素酶報(bào)告基因載體,構(gòu)建重組載體(pMIR-Luc-PDCD4),并進(jìn)行酶切及測(cè)序鑒定。以重組載體(pMIR-Luc-PDCD4)、標(biāo)準(zhǔn)化對(duì)照載體(pMIR-REPORT-β-gal)與pre-miR-21或anti-miR-21共轉(zhuǎn)染Hela細(xì)胞(實(shí)驗(yàn)組),72小時(shí)后分別檢測(cè)Hela細(xì)胞的熒光素酶(Luc
4、)和β半乳糖苷酶的活性,計(jì)箅二者的比值(Luc/β-gal)。同時(shí)設(shè)立三個(gè)對(duì)照組(no miRNA空白對(duì)照組、pre-miR-negative對(duì)照組和anti-miR-negative對(duì)照組),比較各組Luc/β-gal比值,驗(yàn)證miR-21作用靶點(diǎn)的真實(shí)性。
結(jié)果:①利用在線軟件PicTar、MicroCosm Targets和TargetScan預(yù)測(cè)miR-21的作用靶基因。結(jié)果發(fā)現(xiàn)PDCD4可能是miR-21作用的靶
5、基因。②Western blot結(jié)果發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)染pre-miR-21后,細(xì)胞中PDCD4蛋白的表達(dá)水平下調(diào)(P<0.01);轉(zhuǎn)染anti-miR-21后,細(xì)胞中PDCD4蛋白的表達(dá)水平上調(diào)(P<0.05)。③利用pMIR-REPORT熒光素酶報(bào)告基因載體,經(jīng)酶切鑒定和測(cè)序驗(yàn)證,成功構(gòu)建重組載體pMIR-Luc-PDCD4-3'UTR。pMIR-REPORT熒光素酶實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,三個(gè)對(duì)照組(no miRNA空白對(duì)照組、pre-miR-neg
6、ative對(duì)照組和anti-miR-negative對(duì)照組),Luc/β-gal比值接近。實(shí)驗(yàn)組,pre-miR-21共轉(zhuǎn)染組,熒光素酶活性下降約43%(P<0.001);anti-miR-21共轉(zhuǎn)染組,熒光素酶活性升高約37%(P<0.001),表明PDCD4是miR-21的真實(shí)作用靶點(diǎn)。
結(jié)論:⑴在宮頸癌Hela細(xì)胞中,miR-21調(diào)控抑癌基因PDCD4蛋白的表達(dá),PDCD4是miR-21的重要靶基因。⑵miR-21在
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