利用SSR標(biāo)記分析玉米自交系的遺傳多樣性.pdf

1、種質(zhì)資源的遺傳多樣性評價(jià)及種質(zhì)間遺傳關(guān)系研究是玉米育種研究的重要內(nèi)容.本文采用SSR分子標(biāo)記技術(shù),以6個(gè)國內(nèi)和6個(gè)CIMMYT自交系為標(biāo)準(zhǔn)測驗(yàn)種,分析了我國玉米生產(chǎn)上廣泛應(yīng)用的119個(gè)早熟自交系玉米的遺傳多樣性,并整合了我國常用的其它自交系玉米的SSR檢測數(shù)據(jù),初步構(gòu)建了包含375個(gè)玉米自交系的SSR指紋數(shù)據(jù)庫. 1.70對SSR引物在119個(gè)早熟自交系和12個(gè)標(biāo)準(zhǔn)測驗(yàn)種中共檢測出285個(gè)等位基因變異,每對引物檢測出2-8個(gè)等位

2、基因,平均4.07個(gè),多態(tài)性信息量(PIC)范圍從0.18到0.81,平均0.58.119個(gè)早熟和12個(gè)標(biāo)準(zhǔn)測驗(yàn)種共131個(gè)自交系間的遺傳相似系數(shù)(GS)在0.50-0.94之間,平均0.68.利用UPGMA方法將119個(gè)早熟自交系劃分為四平頭、旅大紅骨、PA、PB、:BSSS、Lancaster等6個(gè)類群,劃群結(jié)果與其系譜分析基本相符. 2.基于相同的標(biāo)準(zhǔn)測驗(yàn)種、引物和統(tǒng)一規(guī)范的檢測方法,整合了本實(shí)驗(yàn)室肖木輯博士(2006)分

3、析189個(gè)我國常用玉米自交系遺傳遺傳多樣性時(shí)獲得的SSR檢測數(shù)據(jù),初步構(gòu)建了包含375個(gè)玉米自交系的SSR指紋數(shù)據(jù)庫.70對SSR引物在375個(gè)自交系中共檢測出291個(gè)等位基因變異,每對引物檢測出2-8個(gè)等位基因,平均為4.2個(gè),多態(tài)性信息量(PIC)范圍從0.16到0.88,平均0.60.375個(gè)自交系間遺傳相似系數(shù)(GS)范圍在0.30-0.98之間,平均0.64..利用LIPGMA、主坐標(biāo)、ME、遺傳結(jié)構(gòu)等分析方法將375個(gè)自交系

4、劃分為四平頭、旅大紅骨、PA、PB、BSSS、Lancaster等6個(gè)類群.連鎖不平衡(LD)分析表明70個(gè)SSR位點(diǎn)在全基因組范圍存在廣泛的連鎖不平衡. 3.針對70位點(diǎn)在375個(gè)自交系中檢測結(jié)果獲得的遺傳相似系數(shù)矩陣進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)誤和相關(guān)性分析,結(jié)果表明用于供試自交系遺傳多樣性分析使用的SSR引物數(shù)應(yīng)不少于40個(gè),獲得的等位基因數(shù)應(yīng)不少于180個(gè).比較分析了不同來源標(biāo)準(zhǔn)測驗(yàn)種的SSR檢測結(jié)果,認(rèn)為12個(gè)標(biāo)準(zhǔn)測驗(yàn)種具有較好的穩(wěn)定性和