SD大鼠消化道不同部位乳酸桿菌多樣性分析.pdf

1、目的:分析SD大鼠消化道不同部位乳酸桿菌的多樣性
　　方法:3只6周齡正常SD大鼠普通飼料喂養(yǎng)4周后，分別取喂養(yǎng)飼料、胃、小腸近端、小腸遠(yuǎn)端、大腸的粘液和內(nèi)容物，提取細(xì)菌DNA，采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR-RFLP)方法分析SD大鼠各個(gè)部位乳酸桿菌的多樣性。
　　結(jié)果:
　　(1)用乳酸桿菌屬通用引物L(fēng)actoF/R對(duì)普通飼料及大鼠四個(gè)部位提取的細(xì)菌DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增，擴(kuò)增后電泳顯示，普通飼料沒(méi)

2、有條帶，其余標(biāo)本均有條帶。
　　(2)胃部三個(gè)16S rDNA部分可變區(qū)域基因文庫(kù)中均得到9個(gè)相同的操作分類單元(Operational Taxonomic Unit，OTU，基因序列相似性大于98％)，其中6個(gè)OTU屬于可培養(yǎng)的乳酸桿菌屬菌株，另外三個(gè)屬于不可培養(yǎng)的細(xì)菌克隆子。
　　(3)小腸近端三個(gè)16S rDNA部分可變區(qū)域基因文庫(kù)文庫(kù)中分別得到了10，9，10個(gè)OTU，樣本1和樣本3的10個(gè)OTU相同，樣本2比樣本1

3、和3少了Uncultured Lactobacillus sp.cloneBR15AD06。
　　(4)小腸遠(yuǎn)端三個(gè)16S rDNA部分可變區(qū)域基因文庫(kù)中分別得到了13，12，13個(gè)OTU，樣本1和樣本3的13個(gè)OTU相同，樣本2比樣本1和3少了Lactobacillus johnsonii CRL1452。
　　(5)大腸三個(gè)16S rDNA部分可變區(qū)域基因文庫(kù)中分別得到了10，11，9個(gè)OTU，其中樣本1少了Uncult

4、ured bacterium clone PF4980，樣本3中少了Uncultured bacterium clone ECN343e07和Lactobacillusintestinalis TH4。
　　結(jié)論:
　　(1) SD大鼠胃部、小腸近端、小腸遠(yuǎn)端、大腸四個(gè)部位的內(nèi)容物及粘液均可檢測(cè)到乳酸桿菌。
　　(2)小腸遠(yuǎn)端乳酸桿菌菌種多樣性最高，而小腸近端的乳酸桿菌均勻度最高，胃部乳酸桿菌多樣性和均勻度均低于其他檢