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文檔簡介
1、目的:建立皮膚擴(kuò)張模型,探究皮膚擴(kuò)張早期中miRNA和mRNA表達(dá)譜的變化情況。
方法:取6-8周SD大鼠建立擴(kuò)張模型,在擴(kuò)張早期取下擴(kuò)張皮膚,并利用未擴(kuò)張皮膚作為對照,采用Affymetrix microRNA3.0平臺和Affymetrix GeneChip Rat Gene1.0 ST檢測擴(kuò)張早期miRNA和mRNA的表達(dá)變化;利用統(tǒng)計學(xué)方法初步篩選出表達(dá)發(fā)生變化的miRNA和mRNA,并根據(jù)差異表達(dá)的倍數(shù)篩選出表達(dá)差異
2、較大的關(guān)鍵miRNA。采用TargetScan、miRDB和IPA數(shù)據(jù)庫對關(guān)鍵miRNA進(jìn)行靶點預(yù)測;利用miRNA與靶點mRNA數(shù)量變化呈負(fù)相關(guān)的關(guān)系初步明確擴(kuò)張早期miRNA可能調(diào)控的mRNA靶點,建立miRNA-靶mRNA的一一對應(yīng)關(guān)系。對靶點mRNA進(jìn)行功能分析和通路分析,明確擴(kuò)張早期關(guān)鍵miRNA-靶mRNA-通路的對應(yīng)關(guān)系。
結(jié)果:篩選出了11個滿足統(tǒng)計學(xué)差異和表達(dá)倍數(shù)變化的miRNA,明確了miRNA-靶mRNA
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