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文檔簡介
1、本文主要從以下幾個(gè)部分進(jìn)行論述:
第一部分 慢性胰腺炎miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的分析
目的:探索慢性胰腺炎潛在的分子機(jī)制和生物標(biāo)志物,構(gòu)建miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò),以期指導(dǎo)臨床實(shí)踐中對(duì)該疾病的診斷和治療。
方法:從Gene Expression Atlas收集慢性胰腺炎患者和健康人群的miRNA和mRNA表達(dá)譜,并篩查差異表達(dá)的miRNAs和基因,分析其功能特點(diǎn)和信號(hào)通路,最終構(gòu)建慢性胰腺炎miRN
2、A-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
結(jié)果:共篩選出44個(gè)miRNA相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)基因通路,基于ABL1、MYC和ANAPC13三個(gè)對(duì)慢性胰腺炎影響程度最大的基因構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。另外,發(fā)現(xiàn)NOTCH3、COX5A、THBS1和KARS四個(gè)風(fēng)險(xiǎn)基因和hsa-miR-324-5p這一風(fēng)險(xiǎn)miRNA具有對(duì)慢性胰腺炎較高的預(yù)測準(zhǔn)確度。
結(jié)論:本研究分析了慢性胰腺炎中miRNA和mRNA表達(dá)譜,并篩選出具有較高預(yù)測準(zhǔn)確度的1個(gè)風(fēng)險(xiǎn)miRNA(hsa
3、-miR-324-5p)和4個(gè)風(fēng)險(xiǎn)基因(NOTCH3、COX5A、THBS1和KARS),并將其作為慢性胰腺炎的生物標(biāo)志物,同時(shí)進(jìn)一步深入探討了慢性胰腺炎的發(fā)病機(jī)理,為疾病的靶向診治提供了新的思路。
第二部分 慢性胰腺炎早期診斷血清miRNA生物標(biāo)志物的篩選與鑒定
目的:慢性胰腺炎以不可逆的形態(tài)學(xué)損傷和纖維化為特征,早期診斷和治療可以最大程度地改善胰腺功能、提高生活質(zhì)量。作為重要的標(biāo)志物,miRNA已應(yīng)用于其它臟器的
4、診斷和預(yù)后評(píng)估,但目前尚未作為生物標(biāo)志物應(yīng)用于早期慢性胰腺炎的診斷。本研究的目的在于探索慢性胰腺炎血清中特異性miRNA,以期通過miRNA血清生物標(biāo)志物對(duì)慢性胰腺炎進(jìn)行早期診斷。
方法:通過生物信息學(xué)方法收集Gene Expression Omnibus中慢性胰腺炎患者差異表達(dá)的miRNA,并采取10位早期CP患者、10位晚期CP患者和18位健康對(duì)照者的血清進(jìn)行驗(yàn)證。同時(shí),用基因芯片比較早期慢性胰腺炎患者和晚期患者血清中mi
5、RNA的差異表達(dá)。
結(jié)果:從Gene Expression Omnibus中獲取了在慢性胰腺炎中差異表達(dá)的hsa-miR-320a、hsa-miR-320b、hsa-miR-320c和hsa-miR-320d四個(gè)miRNA,其主要用于預(yù)測晚期慢性胰腺炎。基因芯片結(jié)果顯示,早期慢性胰腺炎患者的hsa-miR-221和hsa-miR-130a差異表達(dá),其預(yù)測準(zhǔn)確度分別為100%和87.5%。聯(lián)合以上6種miRNA,可以提高診斷慢性
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