預(yù)測溫州蜜柑果實貯藏壽命生物標(biāo)記的開發(fā).pdf_第1頁
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文檔簡介

1、柑橘是全球第一大鮮食水果,具有貯藏時間長、銷售范圍大的特點。為確保貯藏果實的品質(zhì),對柑橘果實所處采后生理狀態(tài)的預(yù)測既可豐富柑橘采后生物學(xué)基礎(chǔ)理論,也能為大規(guī)模的柑橘貯藏化解風(fēng)險。本研究利用溫州蜜柑采后貯藏0-50 d的基因芯片數(shù)據(jù)和初生代謝物數(shù)據(jù),結(jié)合聚類分析、主成分分析、最小二乘法判別分析和支持向量機等機器學(xué)習(xí)的方法,旨在將溫州蜜柑采后貯藏時期按生理狀態(tài)進行劃分,挖掘出能反映柑橘采后貯藏期間的不同生理階段和具有代表性的生物標(biāo)記,并且運

2、用qRT-PCR驗證了轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的可靠性。實驗主要結(jié)果如下:
  溫州蜜柑在采后貯藏0-50 d期間,生理狀態(tài)可經(jīng)歷三個階段:第一階段,貯藏前期(0-20 d);第二階段,風(fēng)味最佳期(20-40 d);第三階段,貯藏后期(40-50 d)。通過對基因芯片數(shù)據(jù)分析和驗證發(fā)現(xiàn),以貯藏取樣第一個時間點為參照,谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶(Cit.15371.1.S1_ at)在貯藏前期實時定量表達值在0.8-1.0之間,風(fēng)味最佳期表達值在0.7-

3、0.8之間,貯藏后期表達值低于0.7,具有明顯的階段性特征,因此谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶可作為溫州蜜柑采后貯藏壽命的基因標(biāo)記;通過對代謝物數(shù)據(jù)分析,發(fā)現(xiàn)甘氨酸(Glycine)、3-氨基-6-甲氧基吡啶甲酸(3-Amino-6-methoxypicolinicacid)、丁烯二酸(2-Butenedioic acid)、Cyclohexanone,2-[(dimethylamino)methyl]-四個代謝物含量在溫州蜜柑果實貯藏前期處于一個

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