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文檔簡介
1、相對于兩個親本之間雜交構建的遺傳群體,遺傳信息差異小,多態(tài)性信息含量低,而四交群體含有4個等位基因,有較高多態(tài)信息含量及豐富的遺傳變異性,利于檢測到更多的QTL,且標記圖譜相對密集。本研究針對四向重組自交系群體,通過位點的分離檢驗、兩位點間重組率估計、連鎖群的劃分、位點的排序等步驟提出四向重組自交系遺傳圖譜構建方法。通過模擬研究探討不同類型標記間連鎖檢測的功效和重組率估計的準確度與精確度、遺傳群體樣本容量等問題。作為實例研究,應用該方法
2、分析了一個四向重組自交系群體(墾豐14×墾豐15//黑農48×墾豐19)的SSR分子標記數(shù)據(jù),構建大豆的遺傳連鎖圖,探討四向重組自交系群體構建遺傳圖譜的可行性。
主要研究結果如下:
(1)在不同真實重組率的LOD值比較可以看出,真實重組率越小,檢驗連鎖的LOD值越高,說明重組率越小,又有利于連鎖的檢測。雖然各種標記組合類型的LOD值隨著重組率和群體大小的變化呈現(xiàn)相似的趨勢,但是不同標記組合類型之間存在較大差異。
3、> (2)在不同等位基因的交配中,四個等位基因比三個等位基因、兩個等位基因更容易檢測到兩個位點的連鎖。
(3)用四向重組自交系群體構建遺傳圖譜,群體大小在100個以上,可以滿足重組率小于0.3時(遺傳距離約30cM)的連鎖檢測。
(4)構建了一張含有187個SSR不同的標記,該些標記主要分布在21個大豆的遺傳圖譜中,而這21個遺傳圖譜構成一個連鎖圖譜群。這張圖譜所擁有的基因組的長度在4010.25cM左右,標記與標
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