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文檔簡介
1、本試驗利用SSR分子標記技術對四川農(nóng)業(yè)大學玉米研究所經(jīng)三性(一致性,穩(wěn)定性,特異性)鑒定的新選優(yōu)良玉米自交系共59份材料進行了遺傳多樣性研究,并對其中20份玉米骨干系(包括5個代表四大類群的自交系)進行了DNA指紋圖譜數(shù)據(jù)庫的構建研究,主要結果如下: 1.篩選出了一批對59份新選自交系具有較高多態(tài)性的SSR引物;并篩選出了一套適用于構建20個骨干自交系指紋圖譜的核心引物。 2.利用SSR分子標記技術研究了59個玉米自交系
2、的遺傳多樣性,篩選出的58對引物在供試材料中共檢測出681個等位基因,每對引物檢測到等位基因2~25個,平均為11.7個;每個位點的多態(tài)性信息量(PIC值)變幅為0.34~0.94,平均為0.83±0.107,平均PIC值較大;59個自交系的遺傳相似系數(shù)變化范圍在0.61~0.93之間,平均為0.73±0.032。 3.根據(jù)遺傳相似系數(shù)矩陣,將59個自交系大致聚成10類,它們分別為以Mol7,黃早四,丹340,掖478和5003
3、為代表的Lmncaster,唐四平頭,旅大紅骨,Reid,4大類群和6個其他類群,屬四大類群的材料占供試材料的78%;其中屬Lancaster群的自交系約占總數(shù)的12%,屬唐四平頭群的約占10%,屬旅大紅骨群的約占5%,屬改良Reid群所占的比例較大,約占51%,且在相似系數(shù)0.727處又可分為2個亞類,說明這部分材料親緣關系較近,但也有一定的遺傳差異,屬其他類群的約占22%。說明這些材料與其他材料之間遺傳差異較大。試驗中針對部分己知自
4、交系,從系譜的親緣關系分析,其SSR聚類結果與系譜追蹤有較好的一致性。 4.從80對SSR引物中,篩選出在大部分材料中都僅擴增出一條譜帶、多態(tài)性很強、重復性好且極易識別,能區(qū)分開所有的供試材料的引物篩選到17對,它們可用于構建本實驗的20個玉米自交系的指紋圖譜。這17對SSR引物在20個玉米自交系之間共檢測出73個等位基因變異,每對引物檢測出2~8個等位基因,平均為4.3個。 5.本實驗篩選出了可作為構建供試20個玉米自
5、交系指紋圖譜的核心引物9對,分別是phi080,phil23,umcl061,phil26,phi065,dupssrl3,phil02228,bnlg40,phi083。這9對引物中有些引物對對單個材料能擴增出特征性譜帶,有些引物對兩個材料有特異的譜帶,如引物phi065對M017,黃早四都有特異的分子標記;引物phi080對sAMl00l,黃早四都有特異的分子標記。實驗中篩選到了材料SAMl001,丹340,SCML103,Mol7
6、,441950,SCML202等6個材料的特異分子標記,分別只需要一對特異的引物就可以將他們與其他自交系相區(qū)分;材料黃早四有兩對特異的引物phi080和phi065;其余材料可以這些引物組合來區(qū)分。 6.本實驗對9對核心引物的重復性也作了驗證,無論是調節(jié)反應體系還是反應程序,只能造成非特異的擴增產(chǎn)物的變化,而特異性產(chǎn)物無論在帶型還是在膠板上的相對位置是不會改變的,表明SSR分子標記有較好的穩(wěn)定性和重復性,也說明利用SSR分子標記
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