不同地理株瘧原蟲裂殖子頂端膜抗原1(AMA-1)基因多態(tài)性分析.pdf

1、【目的】研究不同瘧疾流行區(qū)瘧原蟲裂殖子頂端膜抗原1(apicalmembraneantigen-1,AMA-1)基因序列特征,了解不同地理株瘧原蟲AMA-1基因多態(tài)性程度及其分布情況,初步探討產(chǎn)生多態(tài)性的原因與機(jī)制,為進(jìn)一步了解瘧疾流行特征,制定瘧疾防制措施以及瘧疾疫苗的研制提供分子基礎(chǔ)。
　　【方法】經(jīng)顯微鏡檢查瘧原蟲確診的瘧疾病人,征得患者同意后末梢采集濾紙血3滴,干燥后密閉于塑料袋并保存于﹣20℃冰箱中備用,同時詳細(xì)進(jìn)行病案

2、記錄。采用Na2HPO4提取濾紙血中DNA,巢式PCR擴(kuò)增含PvAMA-1Ⅱ區(qū)(793bp)和PfAMA-1Ⅰ區(qū)(505bp)的DNA片段,電泳鑒定擴(kuò)增產(chǎn)物,并將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行純化和測序,利用生物軟件進(jìn)行序列比對分析。
　　【結(jié)果】23例惡性瘧原蟲(pf)樣本中有18種單倍型(H=18),8種單倍型是基因庫中所沒有的,有32個多態(tài)位點(s=32),核苷酸多樣度(π)為0.02501±0.00099,非同義突變率與同義突變率差值(dN

3、-dS)為0.031±0.006,中性檢驗結(jié)果均無統(tǒng)計學(xué)意義,重組事件的最低數(shù)量(Rm)為10。連鎖不平衡指數(shù)R2隨核苷酸遺傳距離增加處于明顯下降趨勢。
　　17例間日瘧原蟲(pv)樣本有產(chǎn)生9種單倍型,只有1種(V3)是新發(fā)現(xiàn),在基因庫中無100％吻合的序列,9個多態(tài)位點(s=9)單倍型,核苷酸多樣度(π)為0.00859±0.00093,非同義突變率與同義突變率差值(dN-dS)為-0.00230±0.00539,但Z檢驗結(jié)果

4、不顯著(P=0.648)。中性檢驗的結(jié)果均無統(tǒng)計學(xué)意義,重組事件的最低數(shù)量(Rm)為2,在整個411bp序列中R2隨著核苷酸遺傳距離增加呈下降趨勢并不明顯。
　　【結(jié)論】惡性瘧原蟲樣本頂端膜抗原1(AMA-1)Ⅰ區(qū)的具有較高的核苷酸和單倍型多態(tài)性?？勺鳛閻盒辕懺x研究的分子標(biāo)志,對了解惡性瘧原蟲的遺傳特征具有參考意義。PfAMA-1Ⅰ區(qū)基因多態(tài)性的產(chǎn)生可能是選擇和基因內(nèi)重組共同作用的結(jié)果。
　　間日瘧原蟲樣本頂端膜抗原1(A