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文檔簡介
1、目的:前列腺癌發(fā)展至去勢抵抗?fàn)顟B(tài)后,便面臨治療上的難題。研究前列腺癌去勢抵抗發(fā)生的機(jī)制可有助于研究更有效的治療方式。miRNA在前列腺癌發(fā)生、發(fā)展及去勢抵抗轉(zhuǎn)變過程中發(fā)揮了重要作用。但其所處的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)有待更進(jìn)一步明確。有必要對前列腺癌去勢抵抗轉(zhuǎn)化相關(guān)miRNA及其所調(diào)控的分子網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行整合分析。
方法:運(yùn)用已經(jīng)研發(fā)出的在預(yù)測miRNA活性方面有著較高的準(zhǔn)確性與效率的調(diào)控模塊—miRNA活性分析方法,篩選出在前列腺癌去勢抵抗轉(zhuǎn)
2、化過程中發(fā)揮活性作用的miRNA;采用熒光定量PCR方法,在激素敏感及去勢抵抗型前列腺癌細(xì)胞株中對感興趣的miRNA的表達(dá)情況進(jìn)行檢測,驗證其在不同狀態(tài)下的前列腺癌細(xì)胞株中存在差異表達(dá);運(yùn)用系統(tǒng)生物學(xué)方法對熒光定量PCR所證實的miRNA的靶基因進(jìn)行GO富集分析、KEGG Pathway富集分析及GeneGo pathway富集分析,并構(gòu)建部分miRNA-mRNA所參與的信號通路網(wǎng)絡(luò),從而完成對 miRNA在前列腺癌去勢抵抗過程中復(fù)雜的
3、網(wǎng)絡(luò)調(diào)控的初步分析。
結(jié)果:有三組基因表達(dá)數(shù)據(jù)集符合篩選標(biāo)準(zhǔn)。從中成功篩選出了有著差異表達(dá)的miRNA,有25個miRNA在兩組、兩組以上基因表達(dá)集里有差異表達(dá);其中有11個miRNA在三組基因表達(dá)集里均有差異表達(dá),且有2個已有文獻(xiàn)報道與前列腺癌去勢抵抗轉(zhuǎn)變相關(guān)。對另外9個和隨機(jī)選取的2個(共11個)miRNA,運(yùn)用熒光定量PCR方法檢測其在激素敏感型前列腺癌細(xì)胞株與去勢抵抗型前列腺癌細(xì)胞株中的相對表達(dá),結(jié)果發(fā)現(xiàn)8個miRNA
4、在激素敏感型前列腺癌細(xì)胞株與去勢抵抗型前列腺癌細(xì)胞株中的存在差異表達(dá)。其中, miR-210、miR-218、miR-346、miR-197和 miR-149在去勢抵抗型前列腺癌細(xì)胞株中高表達(dá)。而miR-122、miR-145和let-7b卻表達(dá)降低。系統(tǒng)性分析結(jié)果顯示:包括AKT信號通路在內(nèi)的七條信號通路,已有報道證實與前列腺癌去勢抵抗轉(zhuǎn)化過程有關(guān)。對miR-218、miR-197、miR-145、miR-122及l(fā)et-7b所調(diào)控的
5、靶基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)這些miRNA參與PI3K、AKT3所處的AKT信號通路調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。而AKT信號通路參與去勢抵抗前列腺癌的生成。而miR-218、miR-197、miR-145、miR-149、miR-122及l(fā)et-7b則調(diào)控Ras和Rho蛋白及SCF復(fù)合體的功能,進(jìn)而通過影響前列腺癌細(xì)胞的G1/S期轉(zhuǎn)化或細(xì)胞周期變化,參與前列腺癌去勢抵抗的轉(zhuǎn)化過程。
結(jié)論:通過對miRNA及其所調(diào)控的分子信號通路數(shù)據(jù)整合分析,
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