POU1F1基因與CAST基因單核苷酸多態(tài)性與兔肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)性分析.pdf

1、垂體特異性轉(zhuǎn)錄因子（Pituitary Specific Transcriptiona Factorl，POU1/Pit-1）和鈣蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin，CAST)在動(dòng)物體內(nèi)主要參與肌肉生長(zhǎng)過程，因其對(duì)肉質(zhì)性狀有重要的決定性作用而被認(rèn)為是影響動(dòng)物經(jīng)濟(jì)性質(zhì)的重要候選基因。本試驗(yàn)隨機(jī)選擇天府黑兔、香檳兔、伊拉兔三個(gè)品種（系）作為研究對(duì)象，利用PCR產(chǎn)物直接測(cè)序法檢測(cè)了家兔POU1F1基因內(nèi)含子5，CAST基因內(nèi)含子5的單核苷

2、酸多態(tài)性(SNPs)，并分析了不同基因型與肉質(zhì)性狀的相關(guān)性，以期為肉兔早期選種提供可靠的候選基因材料，為肉兔育種提供分子理論基礎(chǔ)。本試驗(yàn)的主要研究結(jié)果如下:
　　(1)在CAST基因內(nèi)含子5發(fā)現(xiàn)了一個(gè)變異位點(diǎn)，一共檢測(cè)到3種基因型(GG，TT和GT)。等位基因T和基因型TT在三個(gè)家兔品種中占有優(yōu)勢(shì)。卡方檢驗(yàn)顯示3個(gè)肉兔品種未處于哈溫平衡狀態(tài)，分析顯示3個(gè)家兔群體多態(tài)信息含量(PIC)呈中度多態(tài)。關(guān)聯(lián)性分析表明，無論是背最長(zhǎng)肌還是后

3、腿肌，GT基因型家兔的pH0h和b*0h顯著高于TT基因型(P＜0.05)。對(duì)家兔后腿肌而言，攜帶GT基因型個(gè)體的pH24h顯著高于GG基因型（P＜0.05）。家兔背最長(zhǎng)肌TT基因型肌內(nèi)脂肪含量顯著高于GG和GT基因型（P＜0.05），而后腿基因型GG肌內(nèi)脂肪含量最高。
　　(2)在POU1F1基因內(nèi)含子5發(fā)現(xiàn)一個(gè)變異位點(diǎn)共3種基因型(CC， TT和CT)。等位基因C和基因型CC在三個(gè)家兔品種中占有優(yōu)勢(shì)?？ǚ綑z驗(yàn)顯示3個(gè)肉兔品種未

4、處于哈溫群體平衡狀態(tài)，分析顯示3個(gè)家兔群體多態(tài)信息含量(PIC)處于中度多態(tài)性。關(guān)聯(lián)性分析表明，不同基因型家兔背最長(zhǎng)肌pH(0h，24h)，L*(0h，24h)，a*(0h，24h)，and b*(0h，24h)之間差異未達(dá)到顯著水平。就家兔后腿肌而言，CC基因型pH值顯著高于CT基因型(P＜0.05)。TT基因型家兔蒸煮損失顯著低于CC和CT基因型(P＜0.05)。TT基因型家兔背最長(zhǎng)肌肌內(nèi)脂肪含量顯著低于CC和CT基因型（P＜0.0

5、5）。CT基因型家兔后腿肌內(nèi)脂肪含量顯著低于CC和TT基因型(P＜0.05)。
　　(3) POU1F1基因SNP位點(diǎn)與后腿的pH值之間存在顯著相關(guān)性。同時(shí)，對(duì)家兔背最長(zhǎng)肌和后腿的肌內(nèi)脂肪含量也有顯著性影響。CAST基因不同基因型對(duì)家兔背最長(zhǎng)肌和后腿的pH值無顯著影響，但是對(duì)肉色有明顯影響。
　　(4)對(duì)來自三個(gè)品種共372只肉兔進(jìn)行屠宰并測(cè)定其主要肉質(zhì)性狀指標(biāo)，三個(gè)品種之間的宰前活重及胴體重差異不顯著，通過對(duì)不同品種背最長(zhǎng)