基于EST-SSR和iPBS標記的楊梅遺傳多樣性研究.pdf

1、楊梅(Morella rubra，舊稱Myrica rubra)是楊梅科楊梅屬亞熱帶常綠果樹，主要分布在長江流域及以南地區(qū)，栽培歷史悠久，形成了豐富的品種和品系。本研究基于iPBS和EST-SSR兩種分子標記技術分析了浙江、江蘇和福建等地區(qū)的楊梅主栽品種的遺傳多樣性和親緣關系。主要研究內容和結果如下:
　　1、從已報道的109個EST-SSR引物中篩選出21對高多態(tài)性引物，并從‘荸薺'楊梅轉錄組的UNIGENES序列中新篩選出62

2、個EST-SSR位點，開發(fā)了17條高多態(tài)性EST-SSR引物。應用這38對引物對56份楊梅樣品和一個云南楊梅(M.nana)進行擴增，共獲得214個等位基因，平均每個SSR位點有6個等位基因，觀測雜合度(Ho)平值為0.61;期望雜合度(He)的平均值為0.57;多態(tài)信息含量(PIC)平均值為0.56。
　　2、優(yōu)化了iPBS擴增體系，并從已報道的18條引物中篩選出8條多態(tài)性較好、擴增條帶清晰的iPBS引物。應用這8條引物對35份

3、楊梅樣品和一個云南楊梅進行擴增，共獲得67個條帶，其中有54個為多態(tài)性條帶，多態(tài)性百分率為81％;每條引物可擴增出5-12條條帶，平均8.4條。
　　3、利用38對EST-SSR引物對56份楊梅樣品進行擴增，STRUCRURE結果顯示將其劃分為5個基因庫，余姚白梅擁有獨立的基因庫，遺傳來源較單一，從親緣地理上來看，福建楊梅品種的基因來源單一，基因庫獨立，江蘇地區(qū)多數(shù)品種與浙江北部品種的遺傳背景相近;UPGMA聚類樹將56份楊梅材料