MyD88基因3’-UTR多態(tài)性與雞白痢沙門氏菌抗性關(guān)聯(lián)性分析.pdf

1、雞白痢沙門氏菌是現(xiàn)代養(yǎng)禽業(yè)中最普遍的細(xì)菌性疾病之一。目前，控制雞白痢感染的手段主要有接種疫苗，藥物控制和消除凈化，但這些方法都有短板。隨著抗病育種工作的開展，通過與分子標(biāo)記聯(lián)合選育品種的手段，從遺傳水平上篩選先天抗病能力強(qiáng)的群體是對(duì)抗病原菌感染最深入有效的方法之一。機(jī)體感染雞白痢沙門氏菌會(huì)觸發(fā)先天性免疫通路。其中MyD88作為TLR家族信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路上最重要的一個(gè)銜接蛋白，在抗菌感染相關(guān)的研究中受到廣泛關(guān)注。有研究表明，雞群在感染雞白痢沙

2、門氏菌后，MyD88基因表達(dá)水平上調(diào)，但其mRNA轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的機(jī)制并未見報(bào)道。3'-UTR中的AREs是調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄后表達(dá)的功能性元件。AREs通過調(diào)節(jié)mRNA穩(wěn)定性和翻譯效率來調(diào)控蛋白的生物學(xué)活性是近年的研究熱點(diǎn)。而MyD88基因的3'-UTR與機(jī)體是否易感雞白痢沙門氏菌的關(guān)系尚未見報(bào)道。
　　為了探索MyD88基因的3'-UTR中單核苷酸多態(tài)性是否與抗雞白痢沙門氏菌感染相關(guān)，我們對(duì)優(yōu)質(zhì)SD雞連續(xù)兩個(gè)世代，SD04世代和SD05

3、世代進(jìn)行了遺傳關(guān)聯(lián)研究。兩個(gè)世代共4，400只300日齡種母雞經(jīng)全血平板凝集檢驗(yàn)雞白痢沙門氏菌后，將陽性個(gè)體集成2個(gè)病例組，分別包含SD04世代81例，SD05世代61例;陰性個(gè)體集成2個(gè)對(duì)照組，分別包含SD04世代90例，SD05世代66例。所有樣本血樣靜脈翅下采取，然后采用苯-氯仿萃取法提取全基因DNA，擴(kuò)增樣本MyD88基因的3'-UTR區(qū)域片段，測序后篩選單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)。通過R軟件對(duì)同世代SNP進(jìn)行卡方檢驗(yàn)，對(duì)比兩個(gè)世代間位

4、點(diǎn)、等位基因頻率和基因型頻率在病例-對(duì)照組中分布的差異性。同時(shí)，對(duì)SNP位點(diǎn)構(gòu)建的單倍型進(jìn)行關(guān)聯(lián)雞白痢抗病性分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn):
　　1.兩個(gè)世代共篩選出13個(gè)SNP，其中10個(gè)SNP符合哈迪-溫伯格平衡。SD04世代中SNP4(g.4810293 C＞A)等位基因頻率和基因型頻率在病例-對(duì)照組之間分布都存在顯著差異(p＜0.05)。并且，SNP4的OR值等于0.6088，95％CI為0.531-0.9759，說明該位點(diǎn)對(duì)感染雞白痢沙

5、門氏菌有抵抗作用。SD05世代中只有SNP13等位基因在病例對(duì)照組之間分布存在顯著差異(p＜0.05)，并且SNP13的OR值為1.8012，95％CI為1.0247-1.4827，說明SNP13對(duì)雞白痢沙門氏菌易感。
　　2.SD04世代中SNP1、SNP2(g.4810266A＞G，g.4810372 C＞T)組成的單倍型GG，AA，以及SD05世代中SNP1、SNP2和 SNP11組成的單倍型GTG、ACA、GCG、ACG和

6、GCA，在病例對(duì)照中分布不存在顯著差異(p＞0.05)。但SD04世代中位點(diǎn) g.4810266 A＞G與g.4810372 C＞T;位點(diǎn)SNP5(g.4810191 A＞G)和SNP6(g.4810253A＞G)與位點(diǎn)SNP7(g.4810276 C＞T)，g.4810293 C＞A，SNP8(g.4810352 C＞T)均存在強(qiáng)連鎖不平衡，與SD05世代不同，連鎖不平衡被削弱，說明SD04世代陽性個(gè)體的淘汰改變了SD05世代雞白痢沙