無腦畸形microRNAs表達譜及功能研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、第一部分無腦畸形胎兒腦組織microRNAs的差異表達
  背景:神經管畸形(neural tube defects,NTDs)是人類最常見的一種出生缺陷,其中無腦畸形是最常見的類型之一。NTDs的病因非常復雜,目前認為主要是遺傳和環(huán)境的相互作用造成。microRNAs是一種參與基因轉錄后水平調控的非編碼RNAs,在多種生命活動如胚胎神經發(fā)育中均可發(fā)揮重要作用,隨著人們對microRNAs的逐漸認識,推測其和相應的靶基因有可能在N

2、TDs的發(fā)生中起作用。
  目的:探討無腦畸形胎兒殘存腦組織和正常引產胎兒腦組織中microRNAs的差異表達譜,并運用生物信息學手段預測這些miRNAs的靶基因。
  方法:利用Affymetrix公司推出的GeneChip? miRNA表達譜芯片分析無腦畸形胎兒殘存腦組織和正常引產胎兒腦組織中miRNAs的差異表達。采用實時熒光定量聚合酶鏈反應(Real-time RT-PCR)對差異表達顯著的10個miRNAs進行進一

3、步驗證。運用數(shù)據庫預測上述經過驗證的miRNAs的靶基因。
  結果:1. miRNA芯片初篩結果:與正常對照組相比,無腦兒組有87個miRNAs表達差異顯著(兩組差異>2倍)。其中表達上調的miRNAs有73個,表達下調的有14個。
  2.根據表達差異顯著性程度和在腦組織中表達的特異性,選取上述有顯著表達差異的miRNAs中的10個miRNAs行real-time PCR進行驗證。發(fā)現(xiàn)mir-103、mir-132、mi

4、r-138、mir-185、mir-23a、mir-134、mir-22、mir-34a和mir-149的檢測結果與miRNA芯片初篩結果一致,其中表達上調的有mir-103、mir-132、mir-138、mir-185、mir-23a、mir-134、mir-22和mir-34a;表達下調的為mir-149。mir-125a的結果與芯片結果相反。
  結論:經過miRNA芯片初篩和進一步的real-time PCR驗證,一定數(shù)

5、目的miRNAs可能通過調控多個途徑中的靶基因從而參與無腦畸形的發(fā)生。
  第二部分miR-34a對人腦膠質母細胞瘤中Notch信號通路的影響
  背景:既往研究發(fā)現(xiàn)一些miRNAs對葉酸代謝和NTDs的發(fā)生可能有一定的影響,尤其是miR-34a。根據前期數(shù)據庫預測Notch1和Dll1基因可能是受miR-34a調控的靶基因。同時有研究結果顯示Notch信號通路在胚胎神經形成過程中可能起著重要的調節(jié)作用,故推測miRNA可能

6、通過調控如Notch等重要的信號通路影響神經形成過程。
  目的:根據前期芯片的篩選結果,探討miR-34a對人腦膠質母細胞瘤Notch信號通路的影響。
  方法:利用miR-34a mimics脂質體瞬時轉染人腦膠質母細胞瘤細胞株U87,轉染24h后用real-time RT-PCR和Western blot技術檢測Notch信號途徑中Notch1和Dll1基因mRNA和蛋白表達水平,同時檢測轉染后胞內miR-34a的mR

7、NA水平。
  結果:經轉染miR-34a mimics的U87細胞內has-miR-34a表達明顯升高,而Notch1和Dll1基因的mRNA水平沒有明顯變化,蛋白表達水平則有明顯降低。
  結論:miR-34a mimics可通過上調胞內miR-34a的水平,從而抑制其預測靶基因Notch1和Dll1的蛋白而非mRNA的表達,提示它是在轉錄后的翻譯水平發(fā)揮對靶基因的調控作用。miR-34a可能通過下調Notch信號途徑而

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