氧化葡萄糖酸桿菌甘油脫氫酶的分子模擬.pdf_第1頁
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1、●◆氧化葡萄糖酸桿菌甘油脫氫酶的分子模擬MolecularsimulationofGlycerolDehydrogenaseofGluconobacteroxydans學(xué)科專業(yè):生物化工研究生:夏振東指導(dǎo)教師:盧文玉副教授天津大學(xué)化工學(xué)院二零一零年六月摘要在利用氧化葡萄糖酸桿菌轉(zhuǎn)化甘油生成二羥基丙酮的發(fā)酵過程中,我們發(fā)現(xiàn)甘油濃度的提高對于菌體生長及二羥基丙酮的生成有著明顯的抑制作用為了提高氧化葡萄糖酸桿菌轉(zhuǎn)化甘油的效率、增強(qiáng)菌株的底物耐

2、受性,我們將目光轉(zhuǎn)向研究甘油脫氫酶和底物甘油的作用機(jī)制上。由于目前氧化葡萄糖酸桿菌中的甘油脫氫酶三維結(jié)構(gòu)未知,于是我們需要得到甘油脫氫酶的三維結(jié)構(gòu),以尋找甘油脫氫酶與甘油的作用位點(diǎn)。首先,本文采用同源建模方法,利用同源建模軟件Modeller9v6來構(gòu)建甘油脫氫酶的三維結(jié)構(gòu)。采用的蛋白質(zhì)模板為lyiqA、lkb0A、lkv9A和1lrwA,同源性分別為38%,37%,39%和38%。其次,本文利用分子動(dòng)力學(xué)軟件Gromacs405對同源

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