噬菌體展示DNA測(cè)序結(jié)果的輔助分析程序的開發(fā).pdf

1、測(cè)序噬菌體基因組DNA序列分析，可以提供最可靠的信息顯示的結(jié)果，它可以充分描述具有復(fù)雜性和多樣性的基因，當(dāng)前實(shí)驗(yàn)室通常只能處理這些數(shù)據(jù)的小部分。生物信息學(xué)在各個(gè)領(lǐng)域軟件層出不窮，已被廣泛用于基因序列數(shù)據(jù)采集，處理，分析和管理，并一直在改進(jìn)和完善?，F(xiàn)代測(cè)序技術(shù)的飛速發(fā)展帶動(dòng)了生物信息學(xué)的研究進(jìn)展，在現(xiàn)在的生物領(lǐng)域越來越多的需要計(jì)算機(jī)技術(shù)與基因工程等生物與生物專業(yè)的結(jié)合，引入新的DNA測(cè)序噬菌體展示技術(shù)結(jié)合的結(jié)果，越來越需要在生物技術(shù)和基因

2、工程生物專業(yè)的輔助分析技術(shù)領(lǐng)域開發(fā)一個(gè)簡(jiǎn)單的，免費(fèi)的、功能相對(duì)全面的DNA測(cè)序分析軟件，也勢(shì)必成為一種趨勢(shì)。
　　在21世紀(jì)，這是個(gè)生物信息學(xué)日新月異、飛速發(fā)展的年代，有了DNA的檢測(cè)技術(shù)來推動(dòng)研究者對(duì) DNA的分子結(jié)構(gòu)及其功能進(jìn)行研究，對(duì) DNA測(cè)序技術(shù)和 DNA測(cè)序結(jié)果的處理更是在對(duì) DNA序列深入了解、分析和研究起到了很重要的作用，這也是生物技術(shù)、分子生物學(xué)要更上一個(gè)臺(tái)階所必不可少的關(guān)鍵。
　　噬菌體展示技術(shù)(Phag

3、e Display Techniques，PDT)是將外源的多肽或蛋白質(zhì)的編碼基因通過基因工程的相關(guān)技術(shù)手段插入到編碼噬菌體外殼蛋白基因的適當(dāng)位置，既不影響噬菌體外殼蛋白基因的正常表達(dá)，又能使外源基因編碼的多肽或蛋白質(zhì)與噬菌體外殼蛋白融合并展示在噬菌體的表面的技術(shù)，噬菌體展示技術(shù)現(xiàn)在已經(jīng)廣泛的適用于多種領(lǐng)域。在分子生物技術(shù)的應(yīng)用中噬菌體展示已經(jīng)成為現(xiàn)代生命科學(xué)研究最為常用的手段之一，其中，對(duì)外源插入序列進(jìn)行 DNA測(cè)序是該技術(shù)不可或缺的

4、關(guān)鍵步驟，但是測(cè)序公司交付給研究者的測(cè)序結(jié)果通常包含有大量載體序列，往往需要研究者進(jìn)一步人工提取并翻譯出插入的外源多肽序列，費(fèi)時(shí)費(fèi)力且易出錯(cuò)。
　　MySeq是一個(gè)用Perl編寫的基于B/S架構(gòu)的免費(fèi)網(wǎng)絡(luò)程序，能夠讀取多種DNA測(cè)序儀的測(cè)序結(jié)果，自動(dòng)判別噬菌體載體序列與外源插入序列，并將后者翻譯成為多肽序列，可為國(guó)內(nèi)外相關(guān)研究工作帶來方便。本文便對(duì) MySeq程序的背景、應(yīng)用、實(shí)現(xiàn)流程等各個(gè)方面做了介紹。MySeq程序可從http