子網(wǎng)樹求解一般間隙和長度約束嚴(yán)格模式匹配.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、模式匹配Pattern matching(也稱串匹配String matching)是復(fù)雜性理論中研究最廣泛的問題之一,它是網(wǎng)絡(luò)安全、信息檢索與過濾、文字處理、數(shù)據(jù)庫查詢、音樂檢索、計算生物學(xué)等重要領(lǐng)域的核心問題,同時也是序列模式挖掘技術(shù)的核心與基礎(chǔ)。
  目前學(xué)術(shù)界又重新對字符串匹配提起了興趣,尤其是人類基因組計劃的實施,計算生物學(xué)的興起,又將字符串匹配推到了高潮。為了更好地滿足用戶對模式靈活設(shè)置,在傳統(tǒng)的模式中加入通配符約束,

2、使問題變得更復(fù)雜。雖然目前允許對通配符進(jìn)行約束,但研究方向主要側(cè)重于對間隙值為正的有序模式匹配,然而間隙值為負(fù)的更為一般的模式匹配問題更具普遍意義,且求解難度更大,本文針對以上研究現(xiàn)狀進(jìn)行分析,做了如下工作:
  (1)基于前人的研究工作,提出了更具一般性的模式匹配,即一般間隙和長度約束的嚴(yán)格模式匹配(Strict Pattern Matching with General Gaps and Length Constrains,簡

3、稱SPANGLO):此匹配強(qiáng)調(diào)嚴(yán)格精確;文本串中的字符可以使用多次;模式串中可以含有多個負(fù)間隙;對匹配結(jié)果的長度進(jìn)行了約束。
  (2)深入分析了一般間隙和正間隙之間的關(guān)系,并給出了轉(zhuǎn)換方法,并實驗驗證了這種轉(zhuǎn)換方法的正確性。盡管這種轉(zhuǎn)換方法可以將SPANGLO問題轉(zhuǎn)換為多個已解決的正間隙模式匹配問題,但是這樣的轉(zhuǎn)換方法過于復(fù)雜,最壞情況下,一個SPANGLO問題可以產(chǎn)生出指數(shù)個正間隙模式匹配問題。
  (3)在借鑒網(wǎng)樹概念

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