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文檔簡介
1、生物乙醇是一種可再生的清潔能源,目前主要由植物原料生產(chǎn),正逐漸成為汽油的替代燃料。Clostridium aceticum(C.aceticum)是一種嚴格厭氧的乙酸產(chǎn)生菌,它既能以H2+CO2為能源和碳源自養(yǎng)生長,又能以果糖、丙酮酸、延胡索酸為碳源異養(yǎng)生長。C.aceticum可通過Wood-Ljungdahl途徑將H2+CO2轉(zhuǎn)化為乙酰輔酶A,并進一步代謝產(chǎn)生乙酸。乙醛鐵氧還原蛋白酶(Aldehyde Ferredoxin Oxid
2、oreductase,AOR)嚴格無氧條件下能將乙酸還原為乙醛,乙醛可進一步還原為乙醇。對AOR酶的研究表明,來自于菌株Pyrococcus furiosus和Thermococcus sp.ES-1的AOR酶具有乙酸還原活性。
本論文通過將AOR酶基因過表達,對野生型C.aceticum進行代謝改造,以重組質(zhì)粒的形式將乙酸還原酶AOR的編碼基因轉(zhuǎn)到野生型菌株,使重組型C.aceticum能利用CO2產(chǎn)生乙醇。本論文的研究結果
3、為構建利用CO2產(chǎn)生乙醇的工業(yè)微生物提供了新的途徑:
?。?)C.aceticum AOR酶的生物信息學分析:先從C.aceticum的基因組中的查找到4個AOR酶編碼基因,進行多重序列比對后構建基于AOR酶氨基酸序列的分子進化樹,以進化關系為基礎選出編號為WP_44825795.1和WP_44824935.1的兩個AOR蛋白。對序列進行足跡定位分析,最終得到注釋為dhV、AFOR_N和AFOR_C的結構域,說明這兩個蛋白具有與
4、Thermococcus sp. EP1和P.furiosus AOR酶相似的功能。
?。?)C.aceticum AOR酶的結構預測:蛋白的二級結構預測表明,編號為WP_044825795.1的AOR酶和P.furiosus AOR酶更具相似性,造成AOR酶蛋白結構差異的來源,主要為螺旋(H)其次為折疊結構(E)。通過同源建模預測三級結構,結果表明模板蛋白和目標蛋白的結構不同區(qū)主要集中在保守區(qū)域的端點處,保守區(qū)域內(nèi)部的結構高度
5、一致。
?。?)AOR酶編碼基因上下游序列分析:可視化基因組序列,結果顯示AOR編碼基因閱讀框的方向與上下游基因相反,表明aor基因有一個單獨的啟動子。尋找并分析AOR酶編碼區(qū)上下游的序列,結果表明,在-10到-15位點的區(qū)間“AGGAGG”為AOR酶編碼基因的核糖體結合位點,在-17到-26位點的區(qū)間為“TATTTTTTAAA”Pribnow框。
?。?)C.aceticum過表達AOR酶基因的代謝預測:重構C.ace
6、ticum全基因組酶蛋白的代謝反應途徑,結果顯示C.aceticum全基因組酶主要作用在生物代謝、遺傳信息處理、環(huán)境信號處理、細胞過程、有機系統(tǒng)和致病系統(tǒng)。對C.aceticum重組菌的代謝預測表明,由于AOR酶的過表達,重組菌中的乙酸最終被還原成乙醇,且推測過表達菌株還有可能會產(chǎn)生L-乳酸,甲酸和三羧酸循環(huán)中的中間產(chǎn)物。
?。?)AOR酶基因過表達C.aceticum的構建:根據(jù)前面的分析設計三對引物aor-prim,aor-
7、prim2和aor-prim3,以引物的最佳退火溫度進行PCR擴增,通過連接、轉(zhuǎn)化、篩選和驗證,得到三個重組質(zhì)粒pMTL82151_thl_aor,pMTL82151_thl_aor2和pMTL82151_thl_aor3。將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到E.coli CA434,在通過結合將質(zhì)粒結合轉(zhuǎn)到C.aceticum中,經(jīng)篩選和驗證,得到過表達aor,aor2和aor2的重組型C.aceticum。
?。?)野生型和重組型C.aceti
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