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文檔簡介
1、衰老是所有生物體均需經(jīng)歷的多因子參與的復(fù)雜的生物學(xué)過程,伴隨著一系列衰老相關(guān)的疾病,如神經(jīng)退行性疾病、心血管疾病、內(nèi)分泌系統(tǒng)疾病、骨骼系統(tǒng)疾病和癌癥等的發(fā)生。衰老的進程受到進化上較為保守的信號通路所調(diào)控,這為延緩衰老和預(yù)防衰老相關(guān)疾病提供了可能。一些重要且保守的長壽信號通路,如胰島素信號通路、TOR、AMPK、Sirt均需要或部分需要通過重要的轉(zhuǎn)錄因子FoxO發(fā)揮其作用。FoxO是一個進化上保守的壽命調(diào)節(jié)基因,在酵母、線蟲、果蠅與小鼠中
2、上調(diào)FoxO的表達量都能夠延長壽命。家蠶BmFoxO基因也能調(diào)控家蠶壽命。由于BmFoxO編碼的蛋白屬于轉(zhuǎn)錄因子,故而需要通過調(diào)控下游靶基因來實現(xiàn)生物學(xué)作用。因此,鑒定BmFoxO的靶基因,尋找下游影響衰老的基因就變得尤為重要。本研究主要基于表達譜測序鑒定BmFoxO的靶基因。
本研究主要內(nèi)容包括:⑴將構(gòu)建成功的BmFoxO過表達和干涉載體轉(zhuǎn)染家蠶卵巢細胞系,提取RNA進行表達譜測序。BmFoxO過表達組與對照組比較,篩選得到
3、差異表達基因4144個,其中上調(diào)基因3624個、下調(diào)基因520個。BmFoxO干涉組與對照組比較,篩選得到差異表達基因4563個,其中上調(diào)基因4240個、下調(diào)基因323個。利用維恩圖將兩組基因集取交集后共篩選得到受BmFoxO正向或負向調(diào)控的靶基因212個。其中受BmFoxO正向調(diào)控的基因90個,負向調(diào)控的基因122個。這些差異表達基因共參與了54個信號通路,涉及代謝、蛋白穩(wěn)態(tài)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、衰老及衰老相關(guān)疾病等。根據(jù)BmFoxO特異性識別
4、的保守的結(jié)合基序(TTGTTTAC),對上述的212個基因的上游3K序列進行篩查,得到43個潛在的BmFoxO直接靶基因。⑵經(jīng)熒光定量驗證了BmFoxO能夠正向或負向調(diào)控 BGIBMGA002618、BGIBMGA000459、BGIBMGA012030、BGIBMGA009731、BGIBMGA005655的表達水平,過表達BmFoxO后,BGIBMGA012030的表達水平上調(diào)最為顯著,約為對照組的20倍。其次,截取靶基因上游含有T
5、TGTTTAC基序的調(diào)控序列,進行雙熒光素酶實驗。結(jié)果表明,BmFoxO能夠與靶基因上游調(diào)控序列結(jié)合,顯著激活熒光素酶活性。BmFoxO對BGIBMGA005655的上游序列的調(diào)控活性最高,約為對照組的30倍,進一步對其上游調(diào)控序列進行截短實驗,通過雙熒光素酶實驗,得到BmFoxO調(diào)控BGIBMGA005655上游核心序列位于上游0.8K。⑶利用生物信息學(xué)對 BGIBMGA005655蛋白結(jié)構(gòu)進行分析,發(fā)現(xiàn)其為亮氨酸富集重復(fù)序列蛋白,具
6、有5個亮氨酸拉鏈(LRR);系統(tǒng)發(fā)生分析表明,BGIBMGA005655在各物種中廣泛分布。家蠶幼蟲5齡3天幼蟲組織表達分析顯示,BGIBMGA005655在家蠶頭、表皮、中腸和后部絲腺高量表達。成功構(gòu)建了BGIBMGA005655細胞過表達載體 pIZ/V5-Red-5655和干涉載體pIZ/V5-Red-SiRNA5655。免疫熒光實驗表明,BGIBMGA005655表達的蛋白質(zhì)主要位于細胞質(zhì)中。在細胞中改變 BGIBMGA0056
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