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文檔簡介
1、目的:探討乙型肝炎患者和健康攜帶者乙型肝炎病毒(hepatitis B vires,HBV)S基因和C基因的變異規(guī)律及其臨床意義,為深入分析病毒基因變異可能對病毒生物學(xué)行為以及機體對病毒反應(yīng)的影響提供實驗依據(jù)。
方法:應(yīng)用酶聯(lián)免疫吸附實驗(ELISA)對臨床乙肝可疑病人及健康獻(xiàn)血員進(jìn)行檢測,篩選出乙肝病人和健康攜帶者;實時熒光定量PCR檢測HBV陽性標(biāo)本DNA載量;PCR結(jié)合DNA測序?qū)BV C區(qū)和S區(qū)基因進(jìn)行多態(tài)性檢測
2、,并應(yīng)用DNAstar軟件進(jìn)行比對和分析。`
結(jié)果:①與標(biāo)準(zhǔn)株相比,所有標(biāo)本C區(qū)基因序列均出現(xiàn)變異。在=2例標(biāo)本中出現(xiàn)的突變31處,包括PreC基因3處,C基因28處;其中9處為錯義突變,1處為終止突變,其余21處均為同義突變。nt1827 c→a和nt2221 c→t出現(xiàn)在所有標(biāo)本,有6處同義突變出現(xiàn)于較多標(biāo)本中。4例乙肝病人標(biāo)本在nt1896位發(fā)生g→a突變,另有4例乙肝病人在HBcAgCTL識別表位84-101處發(fā)生
3、2處突變即S87G和197F或I97L。②有15例乙肝病人標(biāo)本S基因測序成功,與標(biāo)準(zhǔn)株相比均出現(xiàn)變異,3例標(biāo)本出現(xiàn)缺失突變,12例標(biāo)本出現(xiàn)單核苷酸突變45處,其中在=2例標(biāo)本中出現(xiàn)的突變9處。2處錯義突變見于所有標(biāo)本,分別為氨基酸R122K突變(nt519 g→a、nt520 a→g)和A194V(nt735c→t)突變,另外5處錯義突變分別見于不同的標(biāo)本。3例標(biāo)本在HBsAg"a"決定簇(AA124-147位)AA126發(fā)生I→T突變
4、,其余標(biāo)本未出現(xiàn)突變。③與標(biāo)準(zhǔn)株相比,16例乙肝病人和3例健康攜帶者標(biāo)本共出現(xiàn)67處堿基突變,其中在≥2例標(biāo)本中出現(xiàn)的突變20處,包括PreS1基因14處,PreS2基因6處。20處突變中,7處為錯義突變,13處為同義突變。同義突變nt3036t→c、nt3039 t→g和nt3066 c→t以及錯義突變L88V出現(xiàn)于所有標(biāo)本,均位于PreS1基因。還有1處錯義突變、5處同義突變見于較多標(biāo)本。④DNA擴增及測序的成功與否與HBV的DNA
5、拷貝數(shù)密切相關(guān),本次研究DNA擴增及測序成功的標(biāo)本其DNA拷貝數(shù)多大于40193/ml,DNA拷貝數(shù)較低的標(biāo)本不易獲得成功。
結(jié)論:①HBV基因組極易發(fā)生突變,C區(qū)基因和s區(qū)基因有9個位點的突變見于所有擴增成功標(biāo)本,為本此研究標(biāo)本所特有,提示這些突變熱點可能具有地域特異性,深入探討這些位點突變的意義,有助于闡明HBV致病的分子機制,并可對乙肝的基因診斷及預(yù)防提供新的實驗依據(jù)。②C區(qū)基因和S區(qū)基因變異可引起HBsAg、HBe
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