中國漢族人群系統(tǒng)性硬化癥的候選基因關聯分析研究.pdf

1、目的:系統(tǒng)性硬化癥(Systemic sclerosis，SSc)是一種以纖維化為特征的自身免疫性疾病，遺傳易感性在其發(fā)病機制中發(fā)揮重要作用。全基因組關聯分析研究(genome-wide association study, GWAS)發(fā)現IRF5和IRF8基因均與白種人群中SSc患者相關。候選基因單核苷酸多態(tài)性(single-nucleotide polymorphisms，SNP)研究結果也顯示TNFSF4，TNFAIP3，CCR6

2、，IRF5，IRF8和ALK1基因的SNP位點和不同種族人群的多種自身免疫性疾病具有相關性，但其是否與中國漢族人群中的SSc患者相關目前尚未有研究報道。因此，本研究的目的是探討TNFSF4, TNFAIP3,CCR, IRF5，IRF8和ALK1基因與中國漢族人群SSc及其不同的臨床亞組之間的相關性，如SSc伴隨抗拓撲異構酶Ⅰ抗體（Anti-topoisomeraseⅠ，也稱為抗Scl-70抗體）陽性組，SSc伴隨肺間質病變(Inter

3、stitial lung disease，ILD)組和SSc伴隨肺動脈高壓(Pulmonary hypertension, PAH)組。
　　方法:本研究納入了1030例SSc患者和1215例健康對照，采用基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜(Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight MassSpectrometry，MALDI-TOF MS)方法對如下6個基

4、因所選14個SNP位點進行基因分型:TNFSF4(rs1234314,rs2205960,rs12039904和rs844648),TNFAIP3(rs5029939,rs6932056和rs5029937), CCR6(rs3093023, rs10946216和rs3093005),IRF5(rs4728142),IRF8(rs11642873和 rs11117432)和 ALK1(rs2277382)。
　　結果:TNFSF

5、4基因的位點rs844648等位基因和基因型頻率都與SSc相關(p=1.7×103和p=5.0×10-3)。TNFAIP3基因的位點rs6932056等位基因頻率在疾病組和對照組之間有顯著差異(p=5.0×10-3)。TNFSF4其他三個位點(rs1234314，rs2205960和rs12039904)和TNFAIP3基因的rs5029939則與SSc表現出相對較弱的相關性(p＜0.05)。上述六個SNP位點均與SSc-ILD亞組具有

6、相關性。TNFSF4基因的單體型rs1234314-rs2205960CG和GT以及rs12039904-rs844648CG和TA均與SSc具有相關性。CCR6基因的位點rs3093023等位基因頻率和基因型頻率均與SSc顯著相關（p=3.2×10-3和p=7.6×10-3）。CCR6基因的單體型rs3093023-rs10946216AT和GC與SSc同樣具有相關性（p=8.6×10-3和p=0.03）。IRF5基因的SNP位點rs

7、4728142在等位基因和基因型頻率上與SSc顯著相關（p=2.8×10-4和p=6.6×10-4），并且與抗SCL-70抗體陽性亞組和SSc-ILD亞組具有相關性(p=2.77×10-4和p=6.64×10-4)。ALK1基因的位點rs2277382僅與SSc-PAH亞組顯著相關(p=7.2×10-3)。
　　結論:本研究在中國漢族人群中開展，結果證實了TNFSF4，TNFAIP3，CCR6和IRF5基因與SSc具有相關性，CC