牦牛幾個功能基因的結(jié)構(gòu)及其系統(tǒng)進(jìn)化研究.pdf

1、電子科技大學(xué)博士學(xué)位論文牦牛幾個功能基因的結(jié)構(gòu)及其系統(tǒng)進(jìn)化研究姓名：鐘金城申請學(xué)位級別：博士專業(yè)：生物醫(yī)學(xué)工程指導(dǎo)教師：劉盛綱20081101摘要9 0 ．6 ％、8 8 ．4 ％、8 3 ．5 ％、8 2 ．3 ％。相應(yīng)氨基酸序列間保守性更高，同源性分別為1 0 0 ％、1 0 0 ％、9 8 ．2 ％、9 4 ．0 ％、9 2 ．2 ％、8 9 ．8 ％、8 9 ．8 ％。牦牛與各物種該基因部分核苷酸序列間堿基變異類型主要表現(xiàn)為堿基

2、轉(zhuǎn)換和顛換，無堿基插入和缺失發(fā)生；序列間單堿基變異位點(diǎn)大多出現(xiàn)在同一位點(diǎn)，符合分子進(jìn)化的中性學(xué)說。( 5 ) 利用H S L 基因外顯子I 部分核苷酸序列進(jìn)行比對分析并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹，結(jié)果表明，普通牛和瘤牛首先聚為一類，再分別與牦牛、水牛、豬、人聚類，最后與大鼠、小鼠聚為一類。該聚類結(jié)果與動物學(xué)上的分類結(jié)果一致。研究表明，牦牛、普通牛和瘤牛三個物種間的遺傳距離遠(yuǎn)小于它們各自與水牛這一物種的遺傳距離，三者之間的親緣關(guān)系也相對于它們與水牛間

3、的親緣關(guān)系較近，故將牦牛、普通牛和瘤牛劃分在同一個屬一牛屬佃儺) ，而將水牛劃分在另一個屬更為合理。( 6 ) 牦牛腳7 2 基因序列全長為1 9 2 6 b p ，無內(nèi)含子，共編碼6 4 1 個氨基酸；牦牛H S P 7 2 基因和H S P 7 2 蛋白與普通牛、豬、人相比存在著一定差異。從H S P 7 2基因到H S P 7 2 蛋白的不同層次上對牦牛、普通牛、豬、人等物種進(jìn)行聚類分析的結(jié)果，同進(jìn)化的理論和其他基因的分析結(jié)果一致

4、。( 7 ) 九龍牦牛、大通牦牛、巴州牦牛和三江黃牛的E P O 基因均由5 個外顯子和4 個內(nèi)含子組成，但其大小和堿基組成差異較大。九龍牦牛、大通牦牛、巴州牦牛和三江黃牛的該基因大小分別為3 2 8 4 b p 、3 2 8 1 b p 、3 2 6 0 b p 和3 2 4 5 b p 。核苷酸序列比較結(jié)果來看，大通牦牛與巴州牦牛、九龍牦牛、三江黃牛的同源性依次為9 9 ．7 ％、9 9 ．6 ％、9 9 ．5 ％，巴州牦牛與九龍牦

5、牛、三江黃牛的同源性依次為9 9 ．5 ％、9 9 ．4 ％，九龍牦牛與三江黃牛的同源性為9 9 ．4 ％，表明牦牛品種間及牦牛與三江黃牛種間在該基因核苷酸水平上均具有較高的保守性，但也具有一定的差異，這種差異是否與牦牛適應(yīng)高海拔低氧生態(tài)環(huán)境有關(guān)，值得深入研究。( 8 ) 大通牦牛、巴州牦牛、九龍牦牛及三江黃牛E P O 氨基酸序列比較結(jié)果表明，大通牦牛與巴州牦牛、九龍牦牛、三江黃牛的同源性依次為1 0 0 ％、9 9 ．5 ％、9 9

6、 ．5 ％，巴州牦牛與九龍牦牛、三江黃牛的同源性均為9 9 ．5 ％，九龍牦牛與三江黃牛的氨基酸序列同源性高達(dá)1 0 0 ％。說明牦牛品種間及與三江黃牛種間在E P O 氨基酸序列上更為保守，但也存在差異，這種差異是否會影響不同物種E P O 的結(jié)構(gòu)和表達(dá)，進(jìn)而對不同物種適應(yīng)高海拔、低氧生態(tài)環(huán)境的能力產(chǎn)生影響，有待進(jìn)一步深入研究。應(yīng)用E P O 基因構(gòu)建大通牦牛、巴州牦牛、九龍牦牛、三江黃牛、普通牛、豬、人等物種的分子系統(tǒng)進(jìn)化樹，表明系