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文檔簡介
1、酞酸酯(Phthalate acid esters,PAEs)是一類典型的難降解有機污染物,具有內(nèi)分泌干擾特性。本文從選育高效降解鄰苯二甲酸二(2-乙基己)酯(Di-(2-ethylehxyl)phthalate,DEHP)的微生物入手,從近海岸潮間帶塑料制品污染的底泥中篩選出一株DEHP高效降解菌YC-YT1,對其降解DEHP的生物降解特性進行了研究;通過全基因組測序獲得了菌株YC-YT1完整的遺傳信息,利用比較基因組學和生物信息學預
2、測并獲取了降解相關的基因;借助傳統(tǒng)分子生物學技術結合物質代謝途徑分析,對相關降解酶進行功能驗證。本論文研究成果如下:
(1)從近海岸潮間帶塑料制品污染的底泥中篩選出一株DEHP高效降解菌YC-YT1,經(jīng)鑒定為赤紅球菌(Rhodococcus ruber)。該菌株能在72小時內(nèi)完全降解100mg/L DEHP,并且可高效降解13種不同類型的酞酸酯化合物和多種芳香族化合物;此外,YC-YT1能有效降解低濃度的DEHP,是現(xiàn)今已報道
3、的DEHP降解菌中底物譜最寬、低濃度DEHP利用率最高的赤紅球菌,為環(huán)境修復酞酸酯污染物儲備了降解菌資源,
(2)菌株YC-YT1在不同環(huán)境條件下降解DEHP能力的單因素研究,結果表明YC-YT1對溫度、pH和鹽離子濃度都擁有較高的耐受度,菌株的接種量對降解能力無明顯影響,添加一定量的葡萄糖可明顯提升菌株的降解能力,采用響應面法對有顯著影響的單因素進行了組合優(yōu)化,菌株最優(yōu)降解條件為額外添加50g/L葡萄糖,pH75,溫度33℃
4、;
(3)液相/質譜分析檢測了菌株YC-YT1降解DEHP過程中的中間產(chǎn)物,DEHP首先降解生成鄰苯二甲酸單(2-乙基己)酯(MEHP),繼而生成鄰苯二甲酸再進一步進入三羧酸循環(huán)。此外,菌株YC-YT1通過調(diào)整其細胞表面疏水性(Cell surface hydrophobicity,CSH)獲取了良好的環(huán)境適應能力,可修復797%-959%的污染土壤和水體,在生物修復被DEHP污染的鹽堿性環(huán)境上具有巨大的應用潛能。
5、(4)利用PacBio三代測序平臺對菌株YC-YT1進行了全基因組測序,序列提交至GenBank(CP023712)。菌株YC-YT1包括一個環(huán)狀基因組(566Mb,GC含量7041%)和兩個質粒(plasmid01,159Kb,GC含量672%,plasmid02,77Kb,GC含量6492%),共預測到5525個CDS,其中5375個CDS被注釋到公共數(shù)據(jù)庫(97%),通過同源比對結合比較基因組學分析,挖掘參與DEHP降解的基因和基
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