PRV感染PK-15細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究及自噬相關(guān)分析.pdf

1、偽狂犬病毒（Pseudorabies virus,PRV）是偽狂犬病的病原體，屬于皰疹病毒科，皰疹病毒屬。豬感染PRV后其臨床伴有發(fā)熱、流產(chǎn)和死胎等癥狀，給養(yǎng)豬業(yè)帶來嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。轉(zhuǎn)錄組是指在一定的生長發(fā)育時(shí)期或生理?xiàng)l件下，細(xì)胞中所有轉(zhuǎn)錄物的總稱。目前偽狂犬病毒感染宿主細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)的相關(guān)研究較少。本研究對(duì)PRV感染12h（P-12）和PRV感染18h（P-18）的豬腎上皮細(xì)胞PK-15進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序，并對(duì)測序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，包括測序數(shù)據(jù)

2、統(tǒng)計(jì)與評(píng)估、數(shù)據(jù)比對(duì)質(zhì)量評(píng)估、基因表達(dá)水平及差異分析、InterProScan功能注釋、GO功能分析、KEGG通路分析。研究結(jié)果表明：（1）與對(duì)照組相比，感染PRV12h后，發(fā)現(xiàn)18546個(gè)顯著差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄本，包含17427個(gè)新轉(zhuǎn)錄本，注釋到基因組的參考基因1119個(gè)；其中17255個(gè)基因轉(zhuǎn)錄水平發(fā)生上調(diào)，1291個(gè)基因轉(zhuǎn)錄水平發(fā)生下調(diào)。同樣感染PRV18h后，發(fā)現(xiàn)47318個(gè)顯著差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄本，包含44993個(gè)新轉(zhuǎn)錄本，注釋到基因組的

3、參考基因2325個(gè)；其中44727個(gè)基因轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)，2591個(gè)基因轉(zhuǎn)錄水平下調(diào)。（2）轉(zhuǎn)錄組測序后，對(duì)IRF3、STAT6和PKR進(jìn)行RT-PCR驗(yàn)證，結(jié)果表明IRF3基因出現(xiàn)上調(diào)，STAT6，PKR基因出現(xiàn)下調(diào)。這些研究結(jié)果為進(jìn)一步了解偽狂犬病毒感染宿主細(xì)胞的作用機(jī)制提供了理論參考。
　　自噬是調(diào)控哺乳動(dòng)物蛋白質(zhì)被細(xì)胞器降解的代謝途徑，大量研究表明自噬對(duì)于維持機(jī)體組織細(xì)胞和生物體內(nèi)的平衡極其重要。研究表明多種病毒感染與自噬密切