長爪沙鼠微衛(wèi)星DNA、RAPD位點(diǎn)篩選和群體遺傳結(jié)構(gòu)分析.pdf

1、長爪沙鼠在生命科學(xué)諸多領(lǐng)域己得到廣泛應(yīng)用，是一種正在被國內(nèi)外開發(fā)的“多功能性”實(shí)驗動物，但有關(guān)長爪沙鼠的遺傳研究甚少，其群體遺傳結(jié)構(gòu)尚不清楚。因此，開展長爪沙鼠基因多樣性研究將有助于了解其基因結(jié)構(gòu)和群體遺傳狀態(tài)，為長爪沙鼠的保種、性狀控制和生產(chǎn)管理提供依據(jù)，促進(jìn)長爪沙鼠實(shí)驗動物化和標(biāo)準(zhǔn)化進(jìn)程。實(shí)驗通過PCR擴(kuò)增技術(shù)從長爪沙鼠近緣動物大、小鼠不同染色體上的62個微衛(wèi)星位點(diǎn)中篩選長爪沙鼠微衛(wèi)星位點(diǎn)，并從隨機(jī)合成的50條RAPD引物中篩選適用

2、于長爪沙鼠的RAPD位點(diǎn)。用試驗篩選出的8個微衛(wèi)星位點(diǎn)和GenBank中的5個有效位點(diǎn)以及20條適合于長爪沙鼠群體遺傳分析的RAPD位點(diǎn)對國內(nèi)2個主要的長爪沙鼠生產(chǎn)單位的4個群體(北京首都醫(yī)科大學(xué)實(shí)驗動物科學(xué)部B1和B2,浙江省實(shí)驗動物中心的Z1和Z2)進(jìn)行遺傳分析。結(jié)果表明，13個微衛(wèi)星位點(diǎn)在沙鼠群體中等位基因數(shù)在1～4之間，等位基因數(shù)平均為2.1538個；有效等位基因數(shù)在1.0000～2.2688之間，平均有效等位基因數(shù)為1.598

3、6；二者的平均值相差較小，各群體內(nèi)微衛(wèi)星標(biāo)記的等位基因頻率分布均勻。20個RAPD引物共擴(kuò)增出了108條清晰穩(wěn)定的譜帶，其中有18個引物的擴(kuò)增帶具有多態(tài)性；擴(kuò)增產(chǎn)物的片段長度在200～2000bp之間，單一引物擴(kuò)增條帶為2～9條。經(jīng)微衛(wèi)星DNA和RAPD分析結(jié)果表明，4個群體均符合Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)；4個群體的微衛(wèi)星位點(diǎn)的基因純合度偏高(0.5027～0.6044)；4個沙鼠群體微衛(wèi)星位點(diǎn)的平均雜合度偏低(0.3956

4、～0.4973)；微衛(wèi)星和RAPD的Nei's基因多樣性指數(shù)和香隆指數(shù)(Shannon's)都偏低。4個群體的聚類分析表明，北京的兩個群體的遺傳距離相對較遠(yuǎn)，而浙江兩個群體相對較近，但經(jīng)統(tǒng)計結(jié)果表明，4個群體之間只有B1與Z2群體差異顯著。 通過以上結(jié)果說明：本實(shí)驗建立了由大、小鼠微衛(wèi)星位點(diǎn)中選取長爪沙鼠微衛(wèi)星位點(diǎn)的方法，并成功篩選出8個長爪沙鼠微衛(wèi)星位點(diǎn)；篩選出了可有效進(jìn)行長爪沙鼠群體遺傳分析的13個微衛(wèi)星位點(diǎn)和20個RAPD