利用miRNA發(fā)現(xiàn)疾病相關(guān)基因.pdf

1、隨著研究者對疾病和基因之間關(guān)系的探討性研究，兩者間的關(guān)聯(lián)逐漸為人們所認(rèn)知，尤其相關(guān)技術(shù)的發(fā)展更是極大促進(jìn)了研究的深入，比如基因測序技術(shù)。隨著高通量測序技術(shù)的不斷發(fā)展，研究者們可以獲取更多更直接的編碼和非編碼物質(zhì)在人類疾病中表達(dá)的數(shù)據(jù)。由于調(diào)控人類發(fā)育的編碼物質(zhì)數(shù)量巨大，如當(dāng)前基因樣本數(shù)高達(dá)兩萬多維，隨著維數(shù)的增加，獲取關(guān)鍵基因的難度也隨之增加。近年來關(guān)于基因和疾病之間的成果越來越多，研究者們發(fā)現(xiàn)眾多種疾病間存在很多共性，比如某些基因在多

2、種疾病中都有相似的表達(dá)，因此需要通過一定方法鑒別與多種疾病相關(guān)的基因，從而探討基因之間的聯(lián)系，研究更深層次的疾病網(wǎng)絡(luò)問題，此背景下PanCancer項目應(yīng)運(yùn)而生，用于研究多種疾病間聯(lián)系的問題。
　　本文針對復(fù)雜疾病和基因之間的關(guān)系進(jìn)行了研究，以PanCancer項目給出的數(shù)據(jù)為對象，基于miRN A和基因之間的靶定關(guān)系，提出了一種利用miRN A發(fā)現(xiàn)疾病相關(guān)基因的方法，避免了直接分析高維基因表達(dá)數(shù)據(jù)的不便。論文取得的創(chuàng)新性成果如下

3、：
　　1.提出了一種利用miRNA發(fā)現(xiàn)復(fù)雜疾病相關(guān)基因的方法，miTOm(miRNA TO mRNA)。miTOm通過分析低維的miRNA數(shù)據(jù)，再結(jié)合miRNA和基因間的靶定關(guān)系，進(jìn)而發(fā)現(xiàn)復(fù)雜疾病的相關(guān)基因，可以避免直接分析高維的mRN A基因表達(dá)數(shù)據(jù)。
　　2.將提出的方法用于PanCancer項目的數(shù)據(jù)分析。首先利用miTOm分析了PanCancer中的幾種單一癌癥的樣本數(shù)據(jù)，接著對六種癌癥樣本合成的組合數(shù)據(jù)進(jìn)行了共性