大豆中疫霉菌特異誘導(dǎo)性啟動子的人工設(shè)計與功能研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、大豆作為世界上一種非常重要的油料作物,在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和人們生活中扮演著重要的角色。而由大豆疫霉引起的大豆根腐病是一種毀滅性的病害,每年都會造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。目前尚未有有效手段預(yù)防和控制該種病害的發(fā)生。近年來,越來越多的研究者將目光投向了基因工程,企圖通過克隆抗病相關(guān)的基因,來推動大豆抗疫霉病的進(jìn)程。而病原誘導(dǎo)型啟動子的克隆與利用作為基因工程中重要的一部分,受到越來越多的重視。啟動子的本質(zhì)是一段存在于基因中的脫氧核苷酸序列。它的作用是與RN

2、A聚合酶結(jié)合并開啟下游基因的轉(zhuǎn)錄。誘導(dǎo)型啟動子作為啟動子的一種,廣泛存在于植物的基因中。在受到特定誘導(dǎo)物刺激后,誘導(dǎo)型啟動子活性增強(qiáng),使得其下游基因的表達(dá)水平明顯提高。誘導(dǎo)型啟動子可以應(yīng)用于基因工程中,為植物的抗脅迫和抗病作出貢獻(xiàn)。本文通過對疫霉菌特異誘導(dǎo)型啟動子的分析,得到了相應(yīng)的疫霉誘導(dǎo)型啟動子順式元件,并對人工設(shè)計合成的啟動子受疫霉誘導(dǎo)表達(dá)的情況進(jìn)行了研究。同時,在研究中我們利用實(shí)時定量PCR進(jìn)行實(shí)驗時發(fā)現(xiàn),大豆中仍缺少合適的內(nèi)參

3、基因,所以我們在大豆中進(jìn)行了內(nèi)參基因的篩選。
  啟動子中存在不同的作用元件,而元件間不同的位置及組合關(guān)系影響著啟動子的特性。已有文章報道了不同作用元件對于啟動子的重要性,它們可能在植物響應(yīng)環(huán)境脅迫或病原物侵染等方面起著重要作用。在基因工程中,作用元件也被廣泛應(yīng)用于人工合成啟動子中。本實(shí)驗室已對超大規(guī)?;蛐酒M(jìn)行了分析,得到了不同大豆品系在疫霉接種前后不同時間點(diǎn)的全基因表達(dá)譜,并獲得了180個疫霉誘導(dǎo)型基因。本研究在此基礎(chǔ)之上,

4、利用生物信息學(xué)方法對已獲得的180個基因的啟動子區(qū)進(jìn)行了系統(tǒng)分析,找到了25個未報到過的結(jié)構(gòu)元件,并對這些結(jié)構(gòu)元件經(jīng)行了設(shè)計和組合,構(gòu)建成不同的合成啟動子。在煙草瞬時表達(dá)體系中,對人工設(shè)計的啟動子進(jìn)行表達(dá)分析、功能驗證與優(yōu)化。通過實(shí)驗我們得到了8個受疫霉誘導(dǎo)表達(dá)的人工合成啟動子,為大豆轉(zhuǎn)基因抗疫霉病害的品種設(shè)計提供了參考。
  實(shí)時定量PCR可以在反應(yīng)進(jìn)行過程中對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行實(shí)時的分析和檢測,相較于常規(guī)的PCR通過終點(diǎn)法來檢測分析

5、擴(kuò)增產(chǎn)物來說,實(shí)時定量PCR具有更高的效率。在實(shí)時定量PCR實(shí)驗中,內(nèi)參基因的選擇非常重要,因為內(nèi)參基因是用來作為目標(biāo)基因表達(dá)量分析的標(biāo)準(zhǔn)。根據(jù)文獻(xiàn)中關(guān)于大豆內(nèi)參基因的研究,本實(shí)驗以大豆的不同組織以及大豆疫霉誘導(dǎo)下大豆根為材料,使用熒光實(shí)時定量PCR方法分析了Cons4、ACT11、TUA soy、Cons15、ACT20、Cons7、CYP2、Cons6、Tubulin和ELF1B10個持家基因的表達(dá)情況。通過BestKeeper、G

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