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文檔簡介
1、本文主要從以下幾個部分進(jìn)行論述:
第一部分 GRN基因多態(tài)性與漢族人群類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎的關(guān)聯(lián)研究
類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(Rheumatoid Arthritis,RA)是一種慢性炎癥性疾病,以滑膜炎、滑膜關(guān)節(jié)的漸進(jìn)侵蝕及軟骨破壞為特征,發(fā)病人群占全世界人口的0.5%到1%。已被證明,類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎的發(fā)病機制與遺傳因素密切相關(guān),并有越來越多的研究表明,遺傳易感性可能促成類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者的臨床表型。盡管易感基因HLA-DRB1是人們認(rèn)
2、為其與RA發(fā)病相關(guān)最強的基因,而又許多研究發(fā)現(xiàn)非HLA基因在RA遺傳易感性中同樣具有重要作用。以單核苷酸多態(tài)性(single nucleotidepolymorphisms,SNP)為基礎(chǔ)的病例-對照關(guān)聯(lián)性研究能有效的鑒別這些非HLA位點。
顆粒蛋白前體(progranulin,PGRN)是由染色體17q32上的GRN基因編碼的一種生長因子,包含7.5個重復(fù)的富含半胱氨酸基序(p-g-f-b-a-c-d-e),其中A-G是完全
3、重復(fù)序列而P是半重復(fù)序列。PGRN介導(dǎo)多種生理和病理的過程,包括早期胚胎發(fā)育、中樞神經(jīng)系統(tǒng)、傷口愈合、腫瘤發(fā)生和炎癥進(jìn)程。研究證實PGRN通過結(jié)合腫瘤壞死因子受體(tumor necrosis factor receptors,TNFR)干擾TNFR/TNFα間的相互作用,可治療小鼠膠原蛋白誘導(dǎo)型關(guān)節(jié)炎,同時發(fā)現(xiàn)在RA患者的血清中,PGRN表達(dá)水平明顯升高,通過檢測PGRN的表達(dá)水平可能是監(jiān)測RA患者疾病活動的一種有效方法。
4、目的:本研究旨在探討中國漢族人群GRN基因單核苷酸多態(tài)性與RA易感性的關(guān)系。
方法:收集就診于山東省立醫(yī)院風(fēng)濕免疫科RA患者738例和山東省立醫(yī)院健康查體中心782例健康對照者,采用TaqMan-PCR法對GRN基因的八個SNPs(rs3859268, rs3785817, rs4792938, rs4792939, rs9897526, rs25646, rs850713和rs5848)分別進(jìn)行基因分型,結(jié)合RA患者臨床表型
5、對SNPs的連鎖不平衡和單倍型進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。
結(jié)果:1.經(jīng)Hardy-Weinberg平衡(HWE)檢驗,所有GRN基因多態(tài)性位點在兩組人群中的基因頻率及基因型頻率的分布均符合HWE檢驗(P>0.05)。
2.統(tǒng)計分析結(jié)果經(jīng)Bonferroni校正后,GRN基因rs3859268位點C/T等位基因在RA組及正常對照組頻率分布(10.0%vs13.8%;90.0%vs86.2%)差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.009,OR
6、=0.69,95%CI0.55~0.86),CC/CT/TT基因型在RA組及對照組頻率分布(1.1%vs2.7%;17.8%vs22.3%;81.2%vs75.1%)差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.037,OR=0.37,95%CI0.16~0.85;P=0.037,OR=0.74,95%0.57~0.95);GRN基因rs9897526位點A/G等位基因在RA組和正常對照組頻率分布(8.3%vs12.2%;91.7%vs87.8%)差異具有
7、統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.003,OR=0.65,95%CI0.51~0.82);AA/AG/GG基因型在RA組及對照組頻率分布(1.2%vs2.0%;14.1%vs20.3%;84.7%vs77.6%)差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.016,OR=0.55,95%CI0.24~1.25;P=0.016,OR=0.64,95%CI0.48~0.83)。余位點的等位基因和基因型在RA組和正常對照組中的頻率分布差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。
8、> 3.GRN基因rs3859268位點和rs9897526位點基因型與RA患者臨床及實驗室指標(biāo)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,未發(fā)現(xiàn)兩位點與RA患者的性別、年齡、病程長短、DAS28評分、ESR、CRP、RF及CCP等實驗室及臨床指標(biāo)具有關(guān)聯(lián)性(P>0.05)。
4.LD分析顯示8個SNP位點(rs3859268,rs3785817,rs4792938,rs4792939,rs9897526,rs25646,rs850713和rs5848)
9、與中國漢族RA人群存在較弱的LD;SHEsis統(tǒng)計學(xué)軟件分析結(jié)果提示,GRN基因的各位點形成的單倍體型與RA之間不存在相關(guān)性(P>0.05)。
結(jié)論:GRN基因rs3859268位點的C等位基因、CC基因型、CT基因型以及rs9897526位點的A等位基因、AA基因型、AG基因型均降低了RA的發(fā)病風(fēng)險。提示GRN基因多態(tài)性與中國漢族RA人群的易感性可能存在相關(guān)性。
第二部分 PTGER4基因多態(tài)性與山東漢族人群強直性
10、脊柱炎易感性的關(guān)系
強直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)是一種慢性炎癥性中軸關(guān)節(jié)病,主要累及骶髂關(guān)節(jié)、椎旁小關(guān)節(jié)和外周關(guān)節(jié),后期可造成關(guān)節(jié)纖維化和骨性強直。遺傳易感性在AS發(fā)病中可能發(fā)揮著重要作用,其具體免疫病理機制尚不明確。眾所周知,腫瘤壞死因子-α(tumor necrosis factor,TNF-α)在炎癥性關(guān)節(jié)病中起到重要作用,抗腫瘤壞死因子拮抗劑的治療已成功應(yīng)用于AS的臨床治療,但仍有
11、部分患者沒有達(dá)到臨床緩解,提示其他炎癥因子可能參與AS的發(fā)病。以單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNP)為基礎(chǔ)的病例-對照關(guān)聯(lián)性研究已經(jīng)廣泛應(yīng)用于疾病易感基因的探索,進(jìn)一步結(jié)合分子細(xì)胞及蛋白水平的研究旨在疾病尋找新的治療靶點。
前列腺素E受體4(prostaglandin E receptor4,PTGER4)基因位于人染色體5p13.1,編碼前列腺素E2受體EP4,是前列腺素E
12、2(prostaglandin E2,PGE2)的受體之一,與骨的生成、自身炎癥反應(yīng)和腫瘤轉(zhuǎn)移等密切相關(guān)。通過全基因關(guān)聯(lián)研究分析,發(fā)現(xiàn)PTGER4與西歐后裔AS易感性相關(guān),但PTGER4基因與山東漢族人群AS尚未發(fā)現(xiàn)相關(guān)性。
目的:探討PTGER4基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)與山東漢族人群AS的關(guān)系。
方法:通過病例-對照相關(guān)性研究,利用TaqMan-PCR基因分型法對600例AS患者(AS組)和620例正常健康人(
13、正常對照組)PTGER4基因SNPs位點rs7726237、rs4133101和rs16870224進(jìn)行基因分型,計算各位點基因型及等位基因分布頻率,比較兩組各位點之間基因型及等位基因頻率分布差異。
結(jié)果:1.經(jīng)Hardy-Weinberg平衡(HWE)檢驗,所有PTGER4基因多態(tài)性位點在兩組人群中的基因頻率及基因型頻率的分布均符合HWE檢驗(P>0.05)。
2.PTGER4基因rs7726237位點A/G等位基
14、因在AS組和正常對照組頻率分布(78.5%vs21.5%;74.7%vs25.3%)差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.026,OR=0.81,95% CI0.67~0.97);GG/AG/AA基因型在AS組及對照組頻率分布(5.3%vs5.2%;32.3%vs40.3%;62.3%54.5%)差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.014,OR=0.90,95%CI0.54~1.51;P=0.014,OR=0.70,95% CI0.55~0.89)。PT
15、GER4基因rs4133101位點和rs16870224位點在AS組和正常對照組中的頻率分布差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。
3.經(jīng)Haploview4.2軟件測定結(jié)果顯示PTGER4基因rs7726237和rs16870224形成一個LD單倍體域;單倍型分析結(jié)果顯示僅有CAA/CAG/TAG/TGG4種單倍型頻率大于3%,但這4種單倍型與疾病風(fēng)險性無關(guān)(P>0.05)。
結(jié)論: PTGER4基因多態(tài)性與山東漢族
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