鵝黑素皮質(zhì)素受體-4基因的克隆及其多態(tài)性研究.pdf

1、黑素皮質(zhì)素受體-4 (MC4R) 在哺乳動物中可與瘦蛋白、神經(jīng)肽Y、α-黑素細胞刺激素等一起調(diào)節(jié)動物體重和能量平衡，在禽類的表達與其采食和體內(nèi)脂肪沉積具有密切關(guān)系。 本研究將MC4R基因作為影響鵝脂肪沉積的侯選基因，通過比較基因組學的方法，克隆并測序鵝MC4R基因編碼區(qū)序列，對其進行序列分析和MC4R氨基酸殘基的特性參數(shù)分析；選用限制性內(nèi)切酶HinfI和TaqI檢測MC4R基因的RFLP；建立不同基因型與鵝重要經(jīng)濟性狀之間的關(guān)聯(lián)

2、分析模型，分析不同基因型與鵝重要經(jīng)濟性狀的相關(guān)性。 1．首次克隆出鵝MC4R基因編碼區(qū)序列，其完整的編碼區(qū)序列長度為996bp。序列在GenBank上登錄，收錄號為DQ482582。 2．核苷酸序列分析表明：鵝與雞的MC4R基因同源性最高(95.3％)，與其它物種的同源性在75％～79％之間；構(gòu)建核苷酸進化樹，發(fā)現(xiàn)禽類較早地與哺乳類動物分化開來，靈長類、食草類動物以及食肉類動物之間在分化上表現(xiàn)出明顯的特異性。 3

3、．鵝MC4R基因編碼331個氨基酸，分析該段蛋白質(zhì)的氨基酸組成，比較不同物種之間的氨基酸序列的同源性，結(jié)果表明：鵝與雞的同源性最高，與哺乳類和魚類次之。 4．對鵝MC4R基因密碼子使用策略分析顯示：不同的氨基酸在該區(qū)域采用不同的密碼子使用策略，Ala偏愛使用GCA，Arg使用AGG、CGC和CGG，Gly使用GGC和GGG，Leu使用CUC和CUG，Pro使用CCU，顯示出密碼子使用的非隨機性。比較鵝與其它物種的密碼子使用策略的

4、相似性，發(fā)現(xiàn)鵝與雞的密碼子使用頻率的相似系數(shù)較高(0.801)，與人的相似系數(shù)為0.630，與其它幾種動物的相似系數(shù)僅為0.5～0.6之間，顯示出物種之間采用不同的密碼子使用策略。 5．分析鵝MC4R氨基酸的親水性、相應區(qū)域位于表面的概率以及電荷密度，結(jié)果顯示，MC4R 8個親水性區(qū)域和7個疏水性區(qū)域以及正負電荷密度和氨基酸殘基位于表面的概率表現(xiàn)出交替性出現(xiàn)的規(guī)律。 6．分析HinfI酶切位點產(chǎn)生的不同基因型(AA型和A