三維圖形可視化在數(shù)量性狀基因定位中的應用.pdf

1、一方面，隨著后基因時代的到來和生物信息的迅速發(fā)展，數(shù)量性狀基因(QuantitativeTraitLoci，簡稱QTL)定位領域發(fā)展迅速。另一方面，自從上世紀80年代后期興起的可視化，在最近幾年理論發(fā)展進入瓶頸后，試圖在應用領域尋求突破，生物信息可視化正是一個方向，隨著QTL定位模型的迅速發(fā)展，原有的文本表達方式和簡單的統(tǒng)計曲線已經(jīng)不能滿足QTL研究者對結果分析和展示的需求。因此，可視化和QTL在這里找到了適合的交叉點?？梢暬赒TL的

2、應用正成為QTL研究的一個熱點。 本文從QTL定位統(tǒng)計模型的分析開始著手，基于改進的MCIM模型，在分析了可視化的對象，即輸出文本結果文件后，提出了自己的可視化方法，在傳統(tǒng)的統(tǒng)計曲線圖可視化中引入了類型三維地形圖可視化效果。本文還創(chuàng)新地設計并實現(xiàn)了多環(huán)境下復雜效應的QTL和上位性的基因架構圖可視化方案。這個方案包括自定義圖元系統(tǒng)，對檢測結果的抽象、省略、精簡和分層，并在可視化中按染色體原有的物理位置生成相對的虛擬坐標。同時，本

3、文在各個視圖中設計和實現(xiàn)了人性化的可視化交互。 本文提出的可視化方法和方案，已在計算機學院圖形圖像技術實驗室和生物信息實驗室合作的自主開發(fā)軟件QTLNetwork中實現(xiàn)。QTLNetwork軟件是基于MFC的多文檔多窗口Window軟件，其中的可視化部分是基于面向對象的可視化圖形庫VTK開發(fā)而成。軟件界面人性化，并整合了改進的MCIM模型算子，擁有強大的可視化模塊。QTLNetwork推出后即獲得了使用者的好評。本文介紹了軟件