節(jié)旋藻二類內(nèi)含子(GII intron)基因特性分析.pdf

1、中國海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文節(jié)旋藻二類內(nèi)含子（GIIintron）基因特性分析姓名：陳叢叢申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：遺傳學(xué)指導(dǎo)教師：茅云翔20090601YADD基序是反轉(zhuǎn)錄酶的標(biāo)志性基序。RNA成熟酶結(jié)構(gòu)域具有對(duì)RNA進(jìn)行加工的功能，序列的保守性不高。HNHDNA核酸內(nèi)切酶結(jié)構(gòu)域在GIIintron轉(zhuǎn)座過程中協(xié)助內(nèi)含子插入目的DNA中，保守的氨基酸序列為H568、N582、H591。二級(jí)結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)該基因編碼的蛋白存在23個(gè)a螺旋、13個(gè)B

2、折疊。由于GIIintron基因在原核生物尤其是藍(lán)藻中通常以高拷貝的形式存在，因此本研究利用實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)測(cè)定了GIIintron基因在節(jié)旋藻基因組內(nèi)的拷貝數(shù)。以勛詔、kaiC兩個(gè)已知在節(jié)旋藻基因組中為單拷貝的基因?yàn)閮?nèi)參基因計(jì)算出GIIintron基因的拷貝數(shù)為2829。本研究還在節(jié)旋藻FAC船438的GIIintron]基因ORf區(qū)域的兩端保守位點(diǎn)設(shè)計(jì)引物，對(duì)節(jié)旋藻FACHB438、341、350、790、793進(jìn)行PCR并測(cè)序，

3、結(jié)果顯示五株節(jié)旋藻的GIIintron基因ORF區(qū)域的保守性很強(qiáng)，相似性均在90％以上，而且在同源區(qū)域均存在兩個(gè)堿基的缺失，除此之外，相比較于節(jié)旋藻FACHB438GIIintronI基因，節(jié)旋藻FAC船438GIIintron2基因、節(jié)旋藻FACFIB793、341、790inmon]基因在222bp的位置還有約5460bp的缺失。這說明節(jié)旋藻GIIintron基因由于其具有特殊的轉(zhuǎn)座機(jī)制，在進(jìn)化的過程該基因的轉(zhuǎn)座造成了其序列上的不完