酵母基因組coiled-coil結構域的系統(tǒng)研究.pdf

1、生物體中，蛋白質通過它們之間或與核酸之間的相互作用來控制細胞多種生命活動。研究表明，大多數蛋白質，特別是調節(jié)蛋白，通常由兩個或更多結構域組成，通過結構域所介導的多肽之間或者多肽與磷脂，小分子和核酸的結合來調節(jié)細胞行為。Coiled coil是蛋白質中一個介導蛋白質相互作用的結構域，我們以coiled coil為模型，研究酵母基因組coiled coil結構域的相互作用網絡。 通過預測，得到了酵母基因組810個蛋白質基因中的899

2、個可能形成coiled coil的序列，克隆得到了其中的890多個。用酵母雙雜交的方法對這些coiled coil進行一對一大規(guī)模的相互作用篩選，得到一個酵母全基因組水平coiled coil間的相互作用網絡。網絡中大多數結構域間緊密連接，網絡中少數高連接度的coiled coil作為中心將網絡連接組織起來。 用生物信息學方法分析coiled coil蛋白的分子功能特征發(fā)現(xiàn)：在分子功能上coiled coil更傾向于分布在與DN