基于Web Services的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)PSE研究.pdf

1、近幾十年來，問題求解環(huán)境(PSE，ProblemSolvingEnvironment)一直是人們研究的熱點之一。隨著人類基因組測序工作的初步完成，生物信息學(xué)這一新興交叉學(xué)科得以產(chǎn)生和發(fā)展，并成為生物學(xué)，計算機科學(xué)以及應(yīng)用數(shù)學(xué)等多種學(xué)科研究的熱點。然而，隨著傳統(tǒng)生物實驗數(shù)據(jù)的快速增長和與蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)相關(guān)的算法層出不窮，如何高效共享大量的數(shù)據(jù)和方便的利用各種工具及方法，成為蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)研究人員面臨的難題。而蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)PS

2、E就成為解決這類問題的非常有效的方法，結(jié)合蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的具體需求，本文建立了基于WebServices的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)PSE實驗系統(tǒng)。 本論文的創(chuàng)新工作主要為以下內(nèi)容： 在充分了解蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的特點及需求，同時結(jié)合PSE的特點，本文建立了基于WebServices的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)PSE。這是目前國內(nèi)建立較早的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)PSE?；赪ebServices的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)PSE為實現(xiàn)資源共

3、享，協(xié)同工作，并提供了易用的高性能計算環(huán)境。這樣就有效解決了用傳統(tǒng)方法研究蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)時遇到的問題。 本文以蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)PSE為研究對象，詳細(xì)闡述了生物信息學(xué)、蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)、網(wǎng)格技術(shù)及PSE的概念、國內(nèi)外現(xiàn)狀及意義。給出了基于WebServices的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)PSE體系結(jié)構(gòu)、各部分功能等，同時也詳細(xì)訴述了在構(gòu)建基于WebServices的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)PSE時所用到的關(guān)鍵技術(shù)，包括數(shù)據(jù)壓縮技術(shù)、負(fù)