關(guān)聯(lián)技術(shù)挖掘基因相互作用關(guān)系的研究.pdf

1、一次微陣列實驗可同時觀測成千上萬基因的表達值，得到含有豐富生物信息的高維DNA微陣列基因表達數(shù)據(jù)。通過分析這些高通量數(shù)據(jù)中基因表達數(shù)據(jù)的關(guān)聯(lián)性，有助于研究未知基因的功能分類，推測基因間的相互作用關(guān)系，尋找共表達的基因類，預(yù)測基因的調(diào)控模式，根據(jù)基因間共調(diào)控或共表達關(guān)系構(gòu)建基因相互作用關(guān)系網(wǎng)絡(luò)。
　　論文以基因芯片表達譜數(shù)據(jù)為數(shù)據(jù)源，采用統(tǒng)計學(xué)中的相關(guān)性理論，研究相關(guān)基因的相互作用關(guān)系，主要開展了以下工作：
　　1.對照轉(zhuǎn)錄因

2、子對基因的調(diào)控關(guān)系表，篩選出受轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控的大腸桿菌操縱子，對篩選出的操縱子基因表達數(shù)據(jù)分別作皮爾遜相關(guān)性度量和斯皮爾曼秩相關(guān)性度量。研究結(jié)果表明，86.33％的操縱子內(nèi)基因的皮爾遜相關(guān)系數(shù)在0.5-1之間分布，在p<0.01的水平上呈顯著性相關(guān)；84.53%的操縱子內(nèi)基因的斯皮爾曼秩相關(guān)系數(shù)分布在0.5-1之間，在p<0.01的水平上呈顯著性相關(guān)。這些結(jié)果在高通量數(shù)據(jù)統(tǒng)計方面為操縱子預(yù)測提供了基因組信息，對操縱子的預(yù)測具有重要意義。<