涼山半細(xì)毛羊QTL定位初步研究.pdf

1、本研究以我國自行培育成功的涼山半細(xì)毛羊作為資源群體，對與實際生產(chǎn)密切相關(guān)的5個體重性狀和8個羊毛性狀進(jìn)行了QTL連鎖分析。體重性狀分別是羔羊初生重、斷奶重、斷奶日增重、育成體重和成年體重；8個羊毛性狀分別是斷奶羊毛纖維長度、育成羊毛纖維長度、成年羊毛纖維長度、育成腹部羊毛纖維長度、成年腹部羊毛纖維長度、育成剪毛量成年剪毛量成年羊毛纖維直徑。 本研究選擇了綿羊1、2、3、9號染色體上的47個微衛(wèi)星標(biāo)記，引物經(jīng)熒光標(biāo)記進(jìn)行多重PCR

2、擴增，并在ABI310測序儀上進(jìn)行檢測。根據(jù)測定結(jié)果，剔除了14個擴增效果不好的標(biāo)記，選擇了33個標(biāo)記進(jìn)行分析。 Cervus2.0軟件統(tǒng)計結(jié)果顯示所選微衛(wèi)星標(biāo)記在涼山半細(xì)毛羊群體中等位基因在3～22個之間，群體雜合度為0.258～0.867，多態(tài)信息含量為0.245～0.853；各位點排除概率范圍為0.137～0.728，累計排除概率達(dá)到了0.999999。只有一個標(biāo)記是低度多態(tài)，其他標(biāo)記均呈現(xiàn)高度或中度多態(tài)性，為該群體分子水

3、平上的研究提供了保障。 利用所選的微衛(wèi)星標(biāo)記對試驗個體進(jìn)行了親子鑒定，所選標(biāo)記的累積非父排除概率(cumulativeprobabilityofexclusion，CPE)達(dá)到了99.999999％，最終確定了13個家系，試驗個體總數(shù)為1003只，其中父母代480只、后代591只，最大家系為188家系(181只)，最小家系為S259(20只)。 對試驗群體的591個后裔的5個體重性狀和8個羊毛性狀進(jìn)行了表型資料的簡單統(tǒng)計

4、分析。結(jié)果表明：初生和斷奶性狀與育成羊和成年羊的一些性狀成顯著相關(guān)，而且家系效應(yīng)對某些性狀有顯著影響。 通過對所選標(biāo)記進(jìn)行遺傳連鎖分析，構(gòu)建了涼山半細(xì)毛羊基因組1、2、3、9號染色體的遺傳連鎖圖譜。連鎖圖長度分別為301.6cM、316.9cM、320.5cM、173.7cM，雖然4條連鎖圖的長度與英國羅斯林研究所公布的最新的綿羊遺傳連鎖圖不同，但標(biāo)記順序相同。 利用QTLexpress在線分析程序，選擇半同胞家系模型，

5、用區(qū)間作圖法對影響上述涼山半細(xì)毛羊5個體重性狀和8個羊毛性狀的數(shù)量性狀位點進(jìn)行了QTL定位分析。QTL定位結(jié)果顯示： 在1號染色體檢測到了4個QTL位點，分別是187家系在255cM處檢測到影響斷奶重的QTL，并達(dá)到了顯著水平；在家系187中249cM處檢測到影響育成羊剪毛量的QTL，在999家系檢測到2個QTL位點，分別為在155cM處檢測到的影響育成羊腹毛長的QTL和149cM處檢測到的影響成年羊腹毛長的QTL位點，但后面3

6、個QTL位點未達(dá)到顯著水平。 在2號染色體檢測到了11個QTL位點，分別為：在187家系254cM處和190家系59cM處檢測到影響初生重的QTL；在187家系的86cM處檢測到影響斷奶日增重的QTL；在187家系86cM處和190家系67cM處檢測到影響斷奶毛長的QTL；在190家系63cM處檢測到影響斷奶重的QTL；在190家系60cM處和191家系75cM處檢測到影響育成羊剪毛量的QTL；在191家系79cM處檢測到影響成

7、年羊剪毛量的QTL；在192家系77cM處檢測到影響育成重的QTL；在192家系115cM處檢測到影響育成羊毛長度的QTL。2號染色體上檢測到的11個QTL位點全部達(dá)到了顯著水平。 在3號染色體檢測到了9個QTL位點，分別為：在187家系79cM處檢測到影響成年羊毛剪毛量的QTL；在189家系16cM處檢測到的影響成年羊毛長度的QTL；在190家系75cM處檢測到影響斷奶重的QTL；在191家系檢測到6個QTL位點，在2cM處檢

8、測到影響斷奶日增重的QTL，在320cM處檢測到影響育成重、育成羊毛長、育成羊腹毛長以及育成羊剪毛量的QTL，在191家系252cM處還檢測到了影響羊毛纖維直徑的QTL，雖然該位點未達(dá)到顯著水平，但該位點與標(biāo)記BMC1009高度連鎖，這與Allain(1996)報道的結(jié)果一致。 在9號染色體共檢測到了12個QTL位點。186家系檢測到了3個QTL位點，分別為：在173cM處影響初生重的QTL；在0cM處檢測到的影響育成體重的QT

9、L，在5cM處檢測到了影響成年羊體重的QTL。187家系檢測到了5個QTL位點，分別為：在98cM處檢測到了影響成年羊體重的QTL；151cM處檢測到了影響斷奶羊毛長度的QTL；在86cM處檢測到了影響成年羊毛長度的QTL；在85cM處檢測到了影響成年羊腹毛長度重的QTL。在188家系57cM處檢測到了影響育成羊體重的QTL。在189家系在0cM處檢測到影響育成羊腹毛長、育成羊剪毛量和羊毛直徑3個QTL，該位點與標(biāo)記ETH225連鎖。