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文檔簡介
1、研究背景:
乳腺癌(BC)是全球女性最常被診斷的癌癥之一,也是女性癌癥死亡的第二大原因。長非編碼RNA(lncRNA)是長度超過200個核苷酸,不具備蛋白編碼功能的RNA,曾被認為是轉(zhuǎn)錄噪音。隨著分子生物學(xué)研究的深入,已有越來越多的證據(jù)表明lncRNAs在生物過程具有重要意義,如在基因組印記,轉(zhuǎn)錄激活和抑制,組織發(fā)育過程中l(wèi)ncRNAs起了極為關(guān)鍵調(diào)解作用。相關(guān)研究同時發(fā)現(xiàn)異常表達的lncRNAs在多種人類疾病中出現(xiàn),其中包括
2、各種類型的癌癥。
中醫(yī)對乳腺癌的病因病機早有認識,對乳腺癌的辨證治療也有獨到見解,而肝郁始終被認為是乳腺癌病因病機的關(guān)鍵,也是辨證施治的要點。這不僅提示肝郁證是乳腺癌的重要分型,也為臨床治療提供思路。隨著現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的發(fā)展,實驗研究和臨床研究均證實肝郁證與乳腺癌密切相關(guān)。最近,諸多l(xiāng)ncRNAs已顯示出在乳腺癌進程中發(fā)揮致癌或抑癌作用。但是,對于lncRNAs與肝郁證型乳腺癌關(guān)系尚缺乏報道。因此,研究lncRNAs與乳腺癌肝郁證的
3、關(guān)系不僅有助于中醫(yī)證型分析應(yīng)用,也有助于篩查乳腺癌高危人群,或能提高早期診斷率,尋找新的藥物靶標(biāo),為臨床研究治療提供新的方案。
研究目的:
篩查lncRNAs在乳腺癌中的表達譜。篩選肝郁證乳腺癌相關(guān)lncRNAs。研究lncRNAs在乳腺癌肝郁證中可能的作用。評估乳腺癌肝郁證相關(guān)lncRNAs的臨床價值。
研究方法:
第一部分實驗,首先通過使用基因芯片構(gòu)建的乳腺癌相關(guān)的lncRNAs庫。隨后利用2
4、2對乳腺癌肝郁證患者的癌及配對癌旁組織樣本,使用實時定量PCR(qRT-PCR)測試并驗證微陣列數(shù)據(jù)結(jié)果的可靠性,篩選出乳腺癌肝郁證相關(guān)lncRNA,最后利用生物信息學(xué)的方法-基因本體論(GO分析)和通路分析(Pathway分析)分析乳腺癌肝郁證相關(guān)lncRNA可能的靶基因和基因產(chǎn)物富集,探討其可能的與乳腺癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)系。
第二部分實驗,通過收集68對辨證為肝郁證的乳腺癌患者與健康對照人群的血清,通過qRT-PCR驗證第一部
5、分中已經(jīng)確認與乳腺癌肝郁證相關(guān)的lncRNA RP11-445H22.4在乳腺癌肝郁證患者及健康人群血清中的表達水平,受試者工作特征(ROC)曲線被用于評估循環(huán)血lncRNA RP11-445H22.4在乳腺癌肝郁證患者中的診斷價值。最后我們研究了循環(huán)血lncRNA RP11-445H22.4表達水平與乳腺癌肝郁證患者的臨床病理因素之間的關(guān)系。
研究結(jié)果:
第一部分實驗,基因芯片結(jié)果顯示在配對的組織樣本中有790條上
6、調(diào)和637條下調(diào)lncRNAs出現(xiàn)顯著差異,qRT-PCR的驗證結(jié)果與芯片結(jié)果一致。通過GO分析,我們發(fā)現(xiàn)上調(diào)的lncRNA與免疫調(diào)節(jié)有關(guān),下調(diào)的lncRNA參與腫瘤的發(fā)展進程。通過Pathway分析,我們發(fā)現(xiàn)44條通路與上調(diào)的轉(zhuǎn)錄本相關(guān),31條通路與下調(diào)的轉(zhuǎn)錄本相關(guān)。其中下調(diào)的lncRNA可能通過參與鈣信號通路影響乳腺癌發(fā)生,上調(diào)的仍然與機體免疫密切相關(guān)。深一步分析,我們發(fā)現(xiàn)一條上調(diào)的lncRNA RP4-583P15.10,其靶基因
7、為ZBTB46,可能通過免疫機制參與乳腺癌的發(fā)生,一條下調(diào)的lncRNA RP11-445H22.4靶基因為WISP2,與乳腺癌的進展密切相關(guān)。
第二部分實驗,通過與健康對照組對比,我們發(fā)現(xiàn)乳腺癌肝郁證患者的外周血lncRNARP11-445H22.4表達水平出現(xiàn)了顯著升高(p<0.001)。ROC分析外周血lncRNARP11-445H22.4水平用于乳腺癌診斷的靈敏度和特異性分別為92%和74%,均高于現(xiàn)有的蛋白標(biāo)志物。與
8、超聲診斷相比,lncRNA RP11-445H22.4診斷的特異性與超聲接近,但靈敏度更高。相關(guān)臨床特征研究發(fā)現(xiàn),外周血lncRNA RP11-445H22.4表達水平還與乳腺癌患者免疫組化及絕經(jīng)情況相關(guān)。
研究結(jié)論:
LncRNA參與了乳腺癌肝郁證的發(fā)生發(fā)展,其可能的機制是參與機體免疫調(diào)節(jié)。與傳統(tǒng)乳腺癌篩查方式相比,外周循環(huán)血lncRNA RP11-445H22.4具有診斷上的優(yōu)勢。具有作為乳腺癌肝郁證患者早期診斷
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