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1、目的:目前,在肝癌相關(guān)基因位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性與肝癌易感性的關(guān)系研究中,DNA修復(fù)基因是一大研究熱點(diǎn),切除修復(fù)交叉互補(bǔ)基因1(ERCC1)為核苷酸切除修復(fù)途徑中的關(guān)鍵基因之一,其基因中不同位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性可能會(huì)影響到DNA切除修復(fù)的功能差異,導(dǎo)致包括腫瘤等各種惡性疾病的發(fā)生。在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中,大多數(shù)患者伴隨著慢性炎癥,且炎癥慢性遷延影響腫瘤的病情。因此,炎癥中的細(xì)胞因子也是肝癌發(fā)生和發(fā)展的重要因素,在這些較熱門的細(xì)胞因子中,腫瘤
2、壞死因子-α(TNF-α)是其中之一。本次研究主要探討ERCC1-4533/-8092、TNF-α-238/-308共四個(gè)基因位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性及全血ERCC1mRNA表達(dá)水平、血清TNF-α含量水平與廣西壯族人群肝癌易感性的關(guān)系及其臨床意義。
方法:采用1∶1病例對(duì)照的研究方法,其中肝癌組為80例新發(fā)未經(jīng)治療的原發(fā)性肝細(xì)胞癌患者,對(duì)照組為同期入院的,其年齡、性別與肝癌組匹配的非腫瘤疾病患者共80例。用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片
3、段長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR-RFLP)技術(shù)檢測(cè)ERCC1-4533/-8092、TNF-α-238/-308共四個(gè)位點(diǎn)的單核苷多態(tài)性,以實(shí)時(shí)定量熒光逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)方法檢測(cè)外周血ERCC1 mRNA表達(dá)水平,運(yùn)用雙抗體夾芯酶聯(lián)免疫吸附法(ELISA)檢測(cè)血清TNF-α含量水平。數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析使用SPSS17.0軟件。哈迪-溫伯格遺傳平衡(Hardy-Weinbergequilibrium)定律檢驗(yàn)用于判斷對(duì)照組研究對(duì)象的基因
4、型分布是否具有群體代表性及可比性。獨(dú)立樣本T檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)分析研究對(duì)象基本信息,方差分析方法統(tǒng)計(jì)分析單核苷酸多態(tài)性分型和等位基因在肝癌組和對(duì)照組之間的分布差異,秩和檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)分析單核苷酸多態(tài)性分型與基因表達(dá)之間的關(guān)系,非條件性Logistic回歸方法統(tǒng)計(jì)分析校正性別、年齡、飲酒、吸煙、HBsAg陽性和血清AFP含量水平等混雜因素,計(jì)算相對(duì)危險(xiǎn)度(OR)及其95%可信區(qū)間(95%CI)。當(dāng)P<0.05時(shí),差別認(rèn)為具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
結(jié)果:
5、
1.肝癌組ERCC1-4533和8092,TNF-α-238和308位點(diǎn)的基因分型分布頻率均符合采用哈迪-溫伯格遺傳平衡定律。
2.ERCC1的單核苷酸多態(tài)性及其基因表達(dá)水平與肝癌易感性的統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果:ERCC1-4533位點(diǎn)的基因分型和等位基因頻率在肝癌組和對(duì)照組的頻數(shù)分布差異不具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。而ERCC1-8092位點(diǎn)的基因分型在肝癌組和對(duì)照組的頻數(shù)分布差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。ERCC1-4533位點(diǎn)的基因突變與肝
6、癌易感易感性無相關(guān)性(OR=1.574,95%CI:0.495-5.003)。與攜帶ERCC1-8092 CC基因型的個(gè)體相比,基因分型為ERCC1-C8092 CA/AA的個(gè)體的肝癌易感性更高(OR=3.255,95%CI:1.954-11.105)。ERCC1-8092位點(diǎn)的等位基因頻率亦在肝癌組和對(duì)照組的頻數(shù)分布差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
肝癌組的全血ERCC1 mRNA表達(dá)水平高于對(duì)照組,ERCC1的mRNA表達(dá)水平與基因分
7、型無關(guān)。
3.TNF-α的單核苷酸多態(tài)性及其基因表達(dá)與肝癌易感性的統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果:TNF-α-238位點(diǎn)的基因分型和等位基因頻率在肝癌組和對(duì)照組的頻數(shù)分布差異不具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。而TNF-α-308位點(diǎn)的基因分型在肝癌組和對(duì)照組的頻數(shù)分布具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。TNF-α-238位點(diǎn)的基因突變與肝癌易感易感性無相關(guān)性(OR=0.831,95%CI:0.180-3.824)。與攜帶TNF-α-308 GG基因型的個(gè)體相比,攜帶TNF-α-3
8、08位點(diǎn)GA/AA基因型的個(gè)體具的肝癌易感性更高(OR=5.288,95%CI:1.287-21.734)。肝癌組中原發(fā)性肝細(xì)胞癌患者血清TNF-α水平顯著高于對(duì)照組,TNF-α-308 GA/AA基因分型的血清含量TNF-α水平較TNF-αGG基因分型高。
結(jié)論:原發(fā)性肝細(xì)胞癌患者的全血ERCC1mRNA和血清TNF-α含量水平高于正常對(duì)照組。ERCC1-8092、TNF-α-308位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性可能與廣西地區(qū)壯族人群原
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