MicroRNAs相關(guān)單核苷酸多態(tài)性與食管癌遺傳易感性研究.pdf

1、食管癌是常見(jiàn)的惡性腫瘤之一，我國(guó)是食管癌發(fā)病率和死亡率最高的國(guó)家，每年新發(fā)病例約25萬(wàn)，占全世界新發(fā)病例數(shù)的一半。食管癌的發(fā)病非常復(fù)雜，但普遍認(rèn)為是環(huán)境、遺傳等多種因素綜合作用的結(jié)果。MicroRNAs（miRNAs）是一類(lèi)長(zhǎng)為20-24個(gè)核苷酸的內(nèi)源性非編碼的單鏈小分子RNA，miRNAs以堿基互補(bǔ)配對(duì)方式結(jié)合到靶基因mRNA的3’非翻譯區(qū)(3'UTR)的miRNAs結(jié)合位點(diǎn)(MREs)，導(dǎo)致mRNA降解或抑制其翻譯，從而實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄后水

2、平的靶基因的調(diào)控。MiRNAs的表達(dá)失調(diào)與腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)。隨著近年來(lái)對(duì)miRNAs研究的深入，發(fā)現(xiàn)miRNAs相關(guān)的SNPs在腫瘤中也發(fā)揮著重要作用。MiRNAs相關(guān)SNPs主要包括三部分，即miRNAs基因自身SNPs，miRNAs合成通路相關(guān)基因SNPs以及miRNAs靶序列SNPs。MiRNAs相關(guān)的SNPs可影響成熟miRNAs的表達(dá)、結(jié)構(gòu)以及其與靶基因的結(jié)合等，使miRNAs調(diào)控發(fā)生異常，從而參與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程。本研

3、究選取miRNAs相關(guān)的5個(gè)位點(diǎn)，探討miRNAs相關(guān)SNPs與食管癌遺傳易感性的關(guān)系，這將為食管癌的病因?qū)W研究提供新的方向，同時(shí)為食管癌的預(yù)防、監(jiān)測(cè)、早期篩查、預(yù)后判斷以及個(gè)體化治療提供理論依據(jù)。
　　 目的:
　　 本研究通過(guò)選取miRNAs相關(guān)的5個(gè)位點(diǎn)，分別是miRNAs基因自身的miRNA146ars2910164和miRNA196a-2rs11614913位點(diǎn)，合成通路基因GEMIN4rs7813位點(diǎn)，以及靶

4、序列基因ErbB4rs1595066和rs16845990位點(diǎn)，探討miRNAs相關(guān)SNPs與食管癌遺傳易感性的關(guān)系。同時(shí)結(jié)合環(huán)境因素評(píng)價(jià)基因-基因/基因-環(huán)境交互作用在食管癌發(fā)生中的作用。為食管癌的預(yù)防、監(jiān)測(cè)、早期篩查、預(yù)后判斷以及個(gè)體化治療提供理論依據(jù)。
　　 方法:
　　 運(yùn)用分子流行病學(xué)的方法，結(jié)合病例-對(duì)照研究，在河南漢族人群中，按性別和年齡進(jìn)行頻數(shù)匹配，選擇381例來(lái)自醫(yī)院的原發(fā)性食管癌病例和426例來(lái)自人群

5、的健康對(duì)照，收集其相關(guān)資料，采集血樣，采用全血基因組DNA提取試劑盒提取基因組DNA，分別采用PCR-RFLP和AS-PCR技術(shù)對(duì)上述5個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行基因型檢測(cè)。用統(tǒng)計(jì)軟件SPSS12.0對(duì)樣本的人群特征進(jìn)行頻數(shù)統(tǒng)計(jì);采用x2檢驗(yàn)比較病例組和對(duì)照組之間年齡、性別、吸煙、飲酒、腫瘤家族史以及基因型頻數(shù)的分布差異;比值比(Oddratio，OR)及其95％可信區(qū)間(95％CI)估計(jì)關(guān)聯(lián)強(qiáng)度，非條件logistic回歸模型計(jì)算調(diào)整性別、年齡、吸煙

6、、飲酒和腫瘤家族史后的OR及其95％CI。利用Hardy-weinberg平衡在線分析軟件(http://ihg2.helmholtz-muenchen.de/cgi-bin/hw/hwal.pl)判斷對(duì)照組的Hardy-Weinberg。利用Haploview4.2軟件計(jì)算ErbB4基因2個(gè)位點(diǎn)間的連鎖不平衡(linkerddimorphisms，LD)值。并利用SHEsis在線軟件(http://analysis.bio-x.cn/

7、myAnalysis.php)進(jìn)行單體型預(yù)測(cè)、構(gòu)建及分析。利用x2檢驗(yàn)比較單體型在病例組和對(duì)照組間的分布差異。MDR2.0軟件分析基因-環(huán)境的交互作用。
　　 結(jié)果:
　　 單位點(diǎn)分析結(jié)果顯示，miR-196a-2基因rs11614913TT基因型攜帶者食管癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)比CC基因型攜帶者降低38％(OR:0.62，95％CI:0.39-0.99)。與GG基因型攜帶者相比，ErbB4基因rs1595066位點(diǎn)AA基因型攜帶者

8、食管癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)降低62％(OR:0.38，95％CI:0.24-0.61)，基因型(GA+AA)的個(gè)體患食管癌的風(fēng)險(xiǎn)則降低38％(OR:0.62，95％CI:0.45-0.85);A等位基因攜帶者食管癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)比G等位基因攜帶者降低36％(OR:0.64，95％CI:0.52-0.78)。ErbB4基因單體型AC和AT可以降低食管癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)，其OR(95％CI)分別為0.75(0.60-0.94)和0.65(0.49-0.86);而

9、單體GC和GT能增加食管癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)，其OR(95％CI)分別為1.46(1.08-1.99)和1.33(1.10-1.62)。MDR分析基因-環(huán)境交互作用顯示，最優(yōu)模型是腫瘤家族史與吸煙交互作用模型，該模型表明，具有腫瘤家族史且吸煙的“高?！比巳旱氖彻馨┌l(fā)病風(fēng)險(xiǎn)是非上述組合的“低?！比巳旱?.66倍。
　　 結(jié)論:
　　 MiR-196a-2基因rS11614913TT基因型和ErbB4基因rs1595066A等位基因