單核苷酸多態(tài)性與乳腺癌新輔助化療療效的關聯研究.pdf

1、目的：利用甘肅省腫瘤醫(yī)院乳腺科甘肅省乳腺病診治中心和甘肅省醫(yī)學科學院腫瘤組織和淋巴細胞庫資源，用TaqMan OpenArray基因分型系統聯合檢測與乳腺癌新輔助化療密切相關的基因及其SNPs。通過以下方面進行深入研究：1.探討甘肅漢族婦女乳腺癌患者新輔助化療密切相關的基因的基因型分布。2.通過基因及其SNPs的研究，篩選新輔助化療方案療效和毒性相關的基因型分布。3.篩選與乳腺癌新輔助化療方案療效及預后相關的遺傳標志物。
　　方法

2、：依據不同的新輔助化療方案遴選符合入組條件的乳腺癌病例，化療前采集患者外周靜脈血2 mL，利用北京百泰克公司DNA提取試劑盒提取基因組DNA；提取的DNA，采用ND2000超微量分光光度計檢測其濃度，要求所有DNA樣本濃度為20~80 ng/μL，OD值在1.7~2.0之間；分裝于1.5 mL Eppendorf（EP）管中，-80℃冰箱保存?zhèn)溆?；用美國應用生物系統（Applied Biosystems，AB）的TaqMan技術，采用T

3、aqMan OpenArray基因分型系統實施SNPs分析；所有患者按照RECIST標準評價療效；隨機選取5％的DNA樣本送金維智公司進行PCR測序分析，以驗證Taqman Openarray基因分型結果的可靠性；采用χ2檢驗比較各基因型化療效果差異及療效關系，分析基因型分布頻率。
　　1.MDR1 rs1045642各基因型頻率分別為AA（18.1%），AG（41.8%），GG（40.1%）；MDR1 rs1128503各基因型

4、頻率分別為AA（38.1%），AG（46.9%），GG（15.0%）；CD44 rs187115各基因型頻率分別為CC（8.6%），CT（29.8%），TT（61.6%）。
　　2.186例乳腺癌新輔助化療患者中，化療受益（CR+PR）為82例，總有效率為44.1%；TNM分期中，II期患者比例為44.6%，III期患者比例為53.2%，IV患者比例為2.2%?？ǚ綑z驗顯示，患者年齡、TNM分期與化療療效均無明顯相關性（p>0.0

5、5）。
　　3.在MDR1基因型rs1045642位點中，野生型（AA）、雜合型（AG）、突變型（GG）的受益率分別占總受益率的10.7%、17.5%、16.4%；AG型與AA型比較，差異無統計學意義（p=0.098），GG型與AA型比較，差異無統計學意義（p=0.081）。在MDR1基因型rs1128503位點中，野生型（AA）、雜合型（AG）、突變型（GG）的受益率分別占總受益率的21.1%，17.1%，5.4%；AG型與AA

6、型比較，差異有統計學意義（p=0.032），提示AA型的化療效果優(yōu)于AG型，GG型與AA型比較，差異無統計學意義（p=0.131）。在CD44基因型rs187115位點中，野生型（CC）、雜合型（CT）、突變型（TT）的受益率分別占總受益率的4.0%，11.9%，28.5%；CT型與CC型比較，差異無統計學意義（p=0.692），TT型與CC型比較，差異無統計學意義（p=0.996）。
　　4. MDR1 rs1045642 GG

7、基因型與中性粒細胞減少癥相關， III-IV度的發(fā)生率為2.8%（2/71），明顯低于AA（9.4%）和AG型（20.3%），χ2=7.188，p=0.027。未發(fā)現MDR1 rs1045642多態(tài)性與血紅蛋白減少、白細胞減少及血小板減少之間的關系。MDR1 rs1128503 GG基因型與中性粒細胞減少癥相關， III-IV度的發(fā)生率為4.5%（1/22），明顯低于AA（10.8%）和AG型（27.5%），χ2=9.077，p=0.0

8、11。未發(fā)現MDR1 rs1128503多態(tài)性與血紅蛋白減少、白細胞減少及血小板減少之間的關系。CD44 rs187115 TT基因型與白細胞減少癥相關，III-IV度的發(fā)生率為2.2%（2/93），明顯低于CC（23.1%）和CT型（6.7%），χ2=10.194，p=0.006。未發(fā)現CD44 rs187115多態(tài)性與血紅蛋白減少、中性粒細胞減少及血小板減少之間的關系。
　　結論：基因芯片檢測方法簡單快速且高通量，適用于大規(guī)模