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文檔簡(jiǎn)介
1、普通菜豆基因組學(xué)及抗炭疽病遺傳研究進(jìn)展普通菜豆基因組學(xué)及抗炭疽病遺傳研究進(jìn)展陳明麗,王蘭芬,趙曉彥,王述民(中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所,北京100081)摘要:普通菜豆是重要的食用豆類之一,在世界各大洲普遍種植。近年來(lái),普通菜豆在遺傳圖譜構(gòu)建、新標(biāo)記開(kāi)發(fā)與利用、抗性基因定位以及比較基因組學(xué)等方面取得了很大進(jìn)展。遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建是基因定位與克隆的基礎(chǔ),是遺傳研究中的重要內(nèi)容;利用分子連鎖圖譜鑒定、標(biāo)記和定位抗病基因?qū)⒃诜N質(zhì)改良和分子標(biāo)
2、記輔助育種方面發(fā)揮重要作用。豆科植物比較基因組學(xué)的研究成果為菜豆遺傳連鎖圖譜的發(fā)展提供了新的思路。本文從普通菜豆遺傳連鎖圖譜的獲得、普通菜豆與大豆同線性比較以及抗炭疽病基因定位等方面進(jìn)行了綜述,以期為普通菜豆遺傳改良和抗病育種提供參考。關(guān)鍵詞:普通菜豆;遺傳連鎖圖;同線性比較;抗菜豆炭疽病CurrentResearchProgress(PhaseolusvulgarisL.)InAnthracnoseResistantGeicsGeno
3、micsonCommonBeanCHENMingliWANGLanfenZHAOXiaoyanWANGShumin(InstituteofCropSciencesChineseAcademyofAgriculturalSciencesBeijing100081)Abstract:Commonbeanisoneofthemostimptantfoodlegumeisgrowninallpartsofthewld.Inrecentyears
4、ithasmadegreatachievementsingeicmapconstructiondevelopmentutilizationofnewmarkersresistancegenemappingcomparativegenomicsofcommonbean.Molecularlinkagemapsareanimptanttoolfgenediscoverycloning.Detectingresistancegenebylin
5、kagemapscanbeusedinmakerassistantedimprovementofcommonbean.Legumecomparativegenomicsresearchprovidedanewwayofdeveloppinggeiclinkagemap.Thispapergivesanoverviewofprogressofcommonbeangeiclinkagemapssyntenymappingbetweencom
6、monbeansoybeangenemappingfanthracnoseresistanceastoprovidesomenewreferencefgenomeresearchmolecularbreedingincommonbean.Keywds:CommonbeanGeiclinkagemapsSyntenycomparativeAnthracnoseresistance收稿日期:修回日期:基金項(xiàng)目:食用豆產(chǎn)業(yè)體系(CARS09)
7、.農(nóng)作物種質(zhì)資源保護(hù)與利用專項(xiàng)作者簡(jiǎn)介:陳明麗,碩士研究生,研究方向?yàn)槠胀ú硕箍固烤也』蚍肿訕?biāo)記。Email:sscmlss.cool@.cnRFLPSSR中美地方品種D364與安第斯品種G19833雜交F9重組自交系群體87150個(gè)SSR標(biāo)記圖譜長(zhǎng)度為1720cM標(biāo)記間的平均距離為19.5cM分11個(gè)連鎖群。BlairMWetal[10]RAPDSCAR西班牙地方品種echa(起源于安第斯基因庫(kù))與中美品種A252雜交F2群體851
8、97個(gè)標(biāo)記(其中有152個(gè)RAPD標(biāo)記,12個(gè)SCAR標(biāo)記,1個(gè)形態(tài)學(xué)標(biāo)記和32個(gè)RFLP標(biāo)記)構(gòu)建菜豆連鎖圖譜。圖譜覆蓋約1401.9cM,平均每個(gè)標(biāo)記間的距離是7.1cM。CristinaRodrguezSurezetal[11]SSRSCAR哥倫比亞栽培品種ICA與野生種G24404雜交BC2F3:5群體157構(gòu)建11個(gè)連鎖群,平均每個(gè)標(biāo)記間的距離是10.4cM。BlairMWetal[12]ESTSSRRGAAFLP中美品種BA
9、T939與安第斯地方品種JaloEEP558雜交F8重組自交群體78261個(gè)標(biāo)記圖譜長(zhǎng)度為1259cM標(biāo)記間的平均距離為3.0cM分11個(gè)連鎖群。LuizRicardoHanaietal[13]CAPsdCAPsRAPD中美品種BAT939與安第斯地方品種JaloEEP558雜交F8重組自交群體75272個(gè)標(biāo)記,圖譜長(zhǎng)度1545cM。McConnellMetal[14]3普通菜豆與其他豆類的同線性比較研究植物比較基因組學(xué)是從比較不同植物
10、的遺傳連鎖圖譜開(kāi)始的。植物基因組研究一般首先從模式生物入手,近年來(lái)國(guó)際上以蒺藜苜蓿作為豆科基因組研究模式植物開(kāi)展了大量研究。蒺藜苜蓿基因組大小約為470Mbp,與普通菜豆、豌豆、綠豆等基因組大小相近。蒺藜苜蓿與豌豆有非常高的共線性關(guān)系普通菜豆和大豆在宏線性水平和微線性水平也有較高的共線性關(guān)系是豆科作物比較基因組研究的好材料[15]。研究表明,許多植物之間都存在同線性現(xiàn)象。最早研究植物間的同線性是基于RFLP標(biāo)記的宏觀比較。通常情況下近緣
11、物種的分子標(biāo)記序列十分保守,只有發(fā)生同臂倒位時(shí)標(biāo)記的序列才會(huì)發(fā)生改變。物種間的宏同線性和微同線性是比較基因組研究的主要內(nèi)容。宏同線性通常是指通過(guò)利用共同的DNA標(biāo)記進(jìn)行比較遺傳作圖,或者用同源序列的計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)綜合分析作圖,獲得物種間保守基因的排列順序。微同線性通常指的是在一個(gè)很短的已經(jīng)在DNA跨疊群上被確定的序列上的保守基因含量和順序。到目前為止幾乎所有種間微同線性的報(bào)道是基于數(shù)量有限的特定區(qū)域的比較來(lái)研究的,該結(jié)論也可能從某一點(diǎn)擴(kuò)展到
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