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文檔簡介
1、大量研究表明,MSTN基因功能缺失突變導(dǎo)致牛、綿羊雙肌表型。自2004年以來,人們試圖在肉用山羊品種中尋找雙肌山羊個體,并研究MSTN基因與山羊生長性狀的關(guān)系。遺憾的是,到目前為止還沒有在山羊中發(fā)現(xiàn)雙肌個體,僅僅在MSTN基因DNA序列上找到一些突變位點(diǎn),各突變位點(diǎn)與山羊生長性狀關(guān)系的研究還比較少。本研究以馬頭山羊、海門山羊、麻城黑山3個地方品種和波爾山羊、努比山羊等2個外來品種為研究對象,用PCR-RFLP結(jié)合DNA測序法分析了MST
2、N基因5'UTR、外顯子1和內(nèi)含子2區(qū)域共計10個突變位點(diǎn)在不同山羊群體中的遺傳多態(tài)性,旨在比較不同品種間MSTN基因的遺傳變異,并對位于5'UTR、外顯子1和內(nèi)含子2共4處多態(tài)位點(diǎn)與波爾山羊生長性狀進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析,探索MSTN基因與山羊生長性狀的關(guān)系,為建立山羊生長性狀分子標(biāo)記輔助選擇提供理論基礎(chǔ)和技術(shù)支撐。
在5'UTR1256 InDel TTTTA位點(diǎn),5個品種山羊群體,均檢測到3種基因型,除努比山羊外,其余4個群
3、體基因型頻率均表現(xiàn)為AA型>AB型>BB型,并且BB基因型頻率極低(0.01-0.09),A等位基因?yàn)閮?yōu)勢等位基因(0.69-0.94);在努比山羊中,AB型(0.55)>BB型(0.24)>AA(0.21)型,努比山羊不存在優(yōu)勢等位基因。
在外顯子1的1388T-A位點(diǎn),僅在波爾山羊群體檢測到3種基因型,頻率為DD型>CD型>CC型,CC型頻率極低(0.02);麻城黑山羊檢測到DD、CD2種基因型,CD型頻率極低(0.0
4、2),馬頭山羊、海門山羊和努比山羊在該位點(diǎn)沒有多態(tài)性,5個山羊群體D等位基因均為優(yōu)勢等位基因(0.83-1.00)。
在內(nèi)含子2區(qū)域共檢測到8個突變位點(diǎn)(4660 C-T、4639 G-A、4769 C-A、4826T-C、4747 T-A、4945 A-G、5643-5647GCGAT-AGAAG和5837G-A)。
波爾山羊群體僅在4639 G-A和4769 C-A位點(diǎn)表現(xiàn)多態(tài)。在其它6個位點(diǎn)均表現(xiàn)為單態(tài)
5、。
4660 C-T和4826 T-C位點(diǎn),努比山羊和馬頭山羊群體均檢測到3種基因型,在馬頭山羊群體,F(xiàn)等位基因?yàn)閮?yōu)勢等位基因;在努比山羊群體,E等位基因?yàn)閮?yōu)勢等位基因。
在5643-5647GCGAT-AGAAG和5837G-A位點(diǎn),除波爾山羊群體表現(xiàn)為單態(tài)外,其它4個山羊群體均表現(xiàn)為多態(tài),在努比山羊群體A等位基因?yàn)閮?yōu)勢等位基因,其它4個山羊群體B等位基因?yàn)閮?yōu)勢等位基因。
在波爾山羊群體,分析
6、了MSTN基因5'UIR1256 InDel TTTTA位點(diǎn)、外顯子11388 T-A位點(diǎn)、內(nèi)含子2區(qū)域4639 G-A和4769 C-A位點(diǎn)對生長性狀的影響。
在1256 InDel TTTTA位點(diǎn),波爾山羊初生體重、體長、90日齡和300日齡體重均表現(xiàn)為AB型>AA型>BB型,且AB型和BB型個體間差異顯著(P<0.05)。初生體高和胸圍也表現(xiàn)為AB型>AA型>BB型趨勢,但差異不顯著。在1388 T-A位點(diǎn),波爾山羊
7、初生體重、體高、90日齡體重均表現(xiàn)為CD型>DD型>CC型,且CD型和CC型個體間差異顯著(P<0.05)。初生體長、胸圍、300日齡體重也表現(xiàn)為CD型>DD型>CC型趨勢,但差異不顯著。上述兩位點(diǎn)的組合基因型關(guān)聯(lián)分析表明,初生體重、體高、90日齡、300日齡體重均表現(xiàn)為ABCD型>ABDD型>AADD型>AACD型>BBDD型>AACC型,ABCD型和AACC型之間差異顯著(P<0.05)。
在4639 G-A位點(diǎn),各性
8、狀(初生體重、體長、體高、胸圍,90日齡和300日齡體重)不同基因型間無差異;在4769 C-A位點(diǎn),除初生體重表現(xiàn)為CD型>CC型>DD型,其中CD型與DD型間差異顯著外,其它性狀各基因型間無差異;兩位點(diǎn)組合基因型關(guān)聯(lián)分析表明:初生體重、初生體長表現(xiàn)為AACD最好,ABCD最差,差異顯著,其它各性狀各組合基因型間差異不顯著。
以上結(jié)果表明,MSTN基因5'UTR InDel位點(diǎn)和外顯子1 SNP位點(diǎn)可能是山羊生長性狀的有
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