豬皮膚褶皺和厚度的初步遺傳學(xué)分析.pdf

1、豬是重要的家養(yǎng)畜種之一，同時(shí)也是人類疾病及健康研究的良好模式動(dòng)物。皮膚是哺乳動(dòng)物最大的器官，在抵御外界病原菌侵害和防止水分丟失等方面起著重要作用。褶皺是皮膚上一凹一凸的條紋。研究豬皮膚褶皺的遺傳控制機(jī)制，可以幫助人們深入了解皮膚褶皺形成的內(nèi)在分子機(jī)理，同時(shí)可為人類美容去皺研究提供參考。皮膚厚度的分子遺傳機(jī)理解析也有助于人們更好地認(rèn)知皮膚，了解皮膚的形態(tài)構(gòu)造變化和生長發(fā)育規(guī)律。
　　本研究包括兩方面內(nèi)容，分別是二花臉頭臉部皮膚褶皺的

2、初步遺傳分析和巴馬香豬的周身皮膚厚度調(diào)查及其初步遺傳關(guān)聯(lián)研究。
　　首先，獲取二花臉豬頭臉部褶皺表型和60K SNP基因型數(shù)據(jù)，進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析，初步揭示皮膚褶皺的遺傳規(guī)律。對333頭二花臉豬進(jìn)行頭臉部正面拍照，用半透明臨摹紙覆蓋照片，使用HB鉛筆在臨摹紙上描繪出臉部輪廓和褶皺痕跡，掃描后利用Photoshop軟件計(jì)算褶皺所占像素與頭臉輪廓所占像素的比例，從而獲得一組褶皺表型數(shù)據(jù)。同時(shí)根據(jù)頭臉部的褶皺程度制定1-5分的評分標(biāo)準(zhǔn)

3、，征集三名志愿者對照著評分標(biāo)準(zhǔn)對這333頭二花臉進(jìn)行褶皺評分，取其平均值，得到另一組褶皺表型數(shù)據(jù)。結(jié)果顯示二花臉褶皺表型差異很大，其變異系數(shù)分別為30.15％和32.63％，說明皮膚褶皺在二花臉群體中存在明顯分化。利用MCMCglmm軟件包采用廣義線性模型，根據(jù)系譜信息，對上述褶皺表型進(jìn)行了遺傳力估計(jì)，其遺傳力分別為0.41和0.81，所以豬皮膚褶皺為高遺傳力性狀。利用GenABEL軟件包，對其表型數(shù)據(jù)與60K基因型數(shù)據(jù)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)

4、分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)最強(qiáng)顯著性SNP位點(diǎn)均為SSC7上的ALGA0040227，該SNP位點(diǎn)位于GRM4基因下游3255bp。頭臉部褶皺少的等位基因?yàn)锳。
　　其次，測定中國地方小型豬品種巴馬香豬成年時(shí)周身9個(gè)典型部位的皮膚厚度，揭示巴馬香豬不同部位皮膚厚度變化規(guī)律及其與7號染色體主效QTL的相關(guān)性。對一個(gè)由319頭300日齡巴馬香豬組成的成年屠宰群體中，隨機(jī)選取50頭，包括27頭母豬和23頭閹割公豬，分別取頭臉、肩、背、肷、臀、胸、下

5、腹、腋下和管等9個(gè)部位的皮膚測量其厚度。利用R語言基本統(tǒng)計(jì)包進(jìn)行不同部位和不同性別間皮膚厚度的差異分析以及不同部位間皮膚厚度的相關(guān)分析。發(fā)現(xiàn)除了下腹皮膚厚度與背部、肩部、頭臉部的不相關(guān)(P＞0.05)外，巴馬香豬不同部位兩兩之間皮膚厚度均呈現(xiàn)不同程度地顯著或極顯著正相關(guān)。在豬7號染色體34.5-36.2 Mb的區(qū)域選取46個(gè)SNPs位點(diǎn)，利用MassARRAY時(shí)間飛行質(zhì)譜技術(shù)進(jìn)行基因分型，結(jié)合上述測定的皮厚表型，利用廣義混合線性模型及R

6、語言SNPassoc軟件包進(jìn)行目標(biāo)候選區(qū)域的關(guān)聯(lián)分析，結(jié)果顯示9個(gè)不同部位的皮膚厚度表型均與候選區(qū)域的某些SNPs存在極顯著的關(guān)聯(lián)，從強(qiáng)到弱依次是肷部、肩部、背部、腋下、臀部、胸部、頭臉、管部和下腹。從而，證實(shí)了巴馬香豬群體存在影響豬皮膚厚度的7號染色體主效QTL。根據(jù)關(guān)聯(lián)分析結(jié)果和基因的生物學(xué)功能確定可能的位置候選基因?yàn)锳NKS1A和HMGA1基因。
　　對豬皮膚褶皺和厚度的初步遺傳研究，揭示了二花臉豬頭臉部褶皺表型的特點(diǎn)和巴馬