銹赤扁谷盜和土耳其扁谷盜線粒體基因組特征及系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf

1、銹赤扁谷盜Cryptolestes ferrugineus和土耳其扁谷盜Cryptolestes turcicus屬鞘翅目Coleoptera扁谷盜科Laemophloeidae，是一類全球性分布第二食性儲(chǔ)糧害蟲，以在粉類和破碎的糧食、谷物中發(fā)生最多。目前，對(duì)于兩種扁谷盜研究主要集中于形態(tài)學(xué)、生態(tài)學(xué)和生物學(xué)特性等方面，分子研究數(shù)據(jù)較少，只有COI基因用于系統(tǒng)發(fā)育分析。因此，對(duì)扁谷盜線粒體基因組的測(cè)序可以豐富現(xiàn)有的線粒體全基因組數(shù)據(jù)，為進(jìn)

2、一步進(jìn)行比較基因組學(xué)研宄提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。本文通過(guò)長(zhǎng)片段PCR（Long-PCR）技術(shù)對(duì)繡赤扁谷盜及土耳其扁谷盜線粒體基因組序列進(jìn)行了擴(kuò)增和測(cè)序，得到全長(zhǎng)并分析其特征。同時(shí)基于繡赤扁谷盜及土耳其扁谷盜在內(nèi)的24種農(nóng)業(yè)昆蟲線粒體基因組數(shù)據(jù)，利用不同方法（最大似然法、鄰接法和貝葉斯法）構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹，分析它們的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。主要結(jié)論如下：
　　1．銹赤扁谷盜和土耳其扁谷盜線粒體基因組長(zhǎng)度分別為15，511bp和15，517bp，注釋得到

3、13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因（PCGs）、16SrRNA和12SrRNA基因、22個(gè)tRNA基因和AT富集區(qū)序列。兩種扁谷盜的線粒體基因組序列具有較高的A+T含量，分別為76.4％和76.9%。
　　2．銹赤扁谷盜及土耳其扁谷盜線粒體蛋白質(zhì)編碼基因均以ATN起始編碼，而終止密碼子具有多樣性，有完整的終止子TAA、TAG及不完整的TA或單個(gè)堿基T。
　　3．兩種扁谷盜22個(gè)tRNA長(zhǎng)度在60-71 bp之間，AT含量分別約為76.2%

4、和77.2%。在這22個(gè)tRNA基因中，除tRNASer基因二氫尿嘧啶臂（DHU stem）結(jié)構(gòu)有缺失外，其他21個(gè)均可折疊成三葉草二級(jí)結(jié)構(gòu)。這些tRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)中普遍存在堿基錯(cuò)配，銹赤扁谷盜和土耳其扁谷盜線粒體tRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)分別存在28處和21處。
　　4．銹赤扁谷盜及土耳其扁谷盜線粒體AT富集區(qū)分別為859bp及857 bp， AT含量高達(dá)86.5%和86.0%。在兩種扁谷盜線粒體AT富集區(qū)中存在不同數(shù)量的Poly-T、Po